100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6568 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  338  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  39.01 
 
 
801 aa  97.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  39.71 
 
 
469 aa  91.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  38.27 
 
 
589 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  42.76 
 
 
516 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  43.44 
 
 
558 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  36.02 
 
 
479 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.46 
 
 
498 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  41.46 
 
 
801 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.65 
 
 
489 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  44.63 
 
 
374 aa  84.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  40.91 
 
 
492 aa  84.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  41.32 
 
 
489 aa  84  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.49 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  39.84 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  39.34 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  36.42 
 
 
492 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  45.6 
 
 
568 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  39.69 
 
 
451 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  42.28 
 
 
461 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  37.04 
 
 
425 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  34.9 
 
 
414 aa  82  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  41.13 
 
 
380 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  39.26 
 
 
603 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.16 
 
 
933 aa  80.5  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  36.29 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  34.85 
 
 
803 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  43.24 
 
 
634 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  39.84 
 
 
547 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  38.46 
 
 
373 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  38.21 
 
 
490 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  41.8 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  35.29 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.84 
 
 
500 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  41.32 
 
 
801 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.64 
 
 
1072 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  38.28 
 
 
452 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.43 
 
 
627 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  42.97 
 
 
497 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  38.4 
 
 
535 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  40 
 
 
426 aa  73.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  36.84 
 
 
548 aa  73.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  38.69 
 
 
709 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  37.9 
 
 
567 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  35.1 
 
 
391 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  37.12 
 
 
732 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  35 
 
 
890 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  34.52 
 
 
384 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.19 
 
 
423 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  40.34 
 
 
1207 aa  67.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  37.19 
 
 
446 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.15 
 
 
488 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  32.8 
 
 
496 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  34.15 
 
 
522 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  27.1 
 
 
1016 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  34.35 
 
 
1128 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  34.13 
 
 
459 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  36.9 
 
 
653 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.11 
 
 
580 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  32.76 
 
 
186 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  32.35 
 
 
597 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  35.85 
 
 
358 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  30.47 
 
 
382 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  31.16 
 
 
1139 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  28 
 
 
412 aa  50.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6622  Ricin B lectin  30.77 
 
 
172 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111925  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0982  hypothetical protein  28.24 
 
 
194 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  27.78 
 
 
494 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  35.96 
 
 
982 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  23.78 
 
 
476 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  24.06 
 
 
497 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  36.26 
 
 
474 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.48 
 
 
531 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  34.57 
 
 
468 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  26.72 
 
 
503 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  27.5 
 
 
493 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  30.88 
 
 
382 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  35.63 
 
 
166 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  31.21 
 
 
574 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  29.37 
 
 
1100 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  34.83 
 
 
824 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  25.43 
 
 
427 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  24.85 
 
 
642 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  27.19 
 
 
569 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  42.67 
 
 
275 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.3 
 
 
644 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  26.42 
 
 
1000 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3769  Ricin B lectin  30.71 
 
 
400 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5090  Ricin B lectin  23.33 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326544  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  28.41 
 
 
240 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  32.56 
 
 
436 aa  44.3  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  31.06 
 
 
333 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
571 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.93 
 
 
648 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  30.59 
 
 
494 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.66 
 
 
756 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  28.57 
 
 
320 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  27.06 
 
 
524 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  27.59 
 
 
1413 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  30.68 
 
 
239 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>