169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7107 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  100 
 
 
803 aa  1632    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  56.4 
 
 
801 aa  832    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  58.91 
 
 
801 aa  863    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  26.44 
 
 
1122 aa  155  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  54.69 
 
 
492 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  52.76 
 
 
479 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  57.48 
 
 
373 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  56.67 
 
 
634 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  53.12 
 
 
890 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.82 
 
 
933 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  51.26 
 
 
452 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 
516 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  51.94 
 
 
732 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.18 
 
 
1072 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  51.49 
 
 
384 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  45.32 
 
 
492 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  49.58 
 
 
489 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  45.24 
 
 
368 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  49.17 
 
 
603 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  48.74 
 
 
558 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  49.57 
 
 
446 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  47.24 
 
 
451 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  45.32 
 
 
417 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  41.73 
 
 
589 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  47.11 
 
 
472 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  43.41 
 
 
426 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  44.19 
 
 
461 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.6 
 
 
627 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  43.2 
 
 
414 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.45 
 
 
489 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  44.19 
 
 
801 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  43.9 
 
 
374 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  40.91 
 
 
469 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  44.53 
 
 
490 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  45.38 
 
 
1207 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.63 
 
 
498 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.24 
 
 
493 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  40.25 
 
 
380 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  43.7 
 
 
497 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  38.85 
 
 
548 aa  98.2  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  39.75 
 
 
547 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  44.07 
 
 
468 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 
709 aa  95.1  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.46 
 
 
568 aa  95.1  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.86 
 
 
500 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
391 aa  94  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  42.28 
 
 
567 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  42.86 
 
 
535 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  43.55 
 
 
642 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  37.5 
 
 
522 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  40.17 
 
 
1128 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35.86 
 
 
1016 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.6 
 
 
476 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  37.5 
 
 
488 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.71 
 
 
531 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  38.52 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  34.85 
 
 
165 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.58 
 
 
580 aa  77  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.51 
 
 
815 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  27.84 
 
 
688 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.21 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  39.17 
 
 
574 aa  71.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  43.21 
 
 
468 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35.34 
 
 
496 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  43.75 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  25.58 
 
 
726 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.85 
 
 
503 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  39.26 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  31.97 
 
 
794 aa  68.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  46.15 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 
571 aa  67.8  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  34.23 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  26.95 
 
 
1217 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  34.4 
 
 
465 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.92 
 
 
648 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  43.18 
 
 
982 aa  64.7  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  36.97 
 
 
1577 aa  64.7  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  34.45 
 
 
653 aa  64.3  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  37.17 
 
 
358 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  31.54 
 
 
497 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
756 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  32.45 
 
 
186 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  32.26 
 
 
569 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  33.58 
 
 
737 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  32.81 
 
 
1100 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.64 
 
 
618 aa  60.1  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.55 
 
 
695 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  28.08 
 
 
597 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  30.53 
 
 
401 aa  58.9  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  38.64 
 
 
483 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  42.86 
 
 
494 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  31.58 
 
 
166 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  42.05 
 
 
863 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.28 
 
 
644 aa  57.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  40.4 
 
 
943 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  28.03 
 
 
672 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  28 
 
 
1000 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  30.89 
 
 
178 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.57 
 
 
495 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  30.66 
 
 
320 aa  56.2  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>