163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3581 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  59.03 
 
 
803 aa  896    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  57.57 
 
 
801 aa  830    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  100 
 
 
801 aa  1607    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  62.41 
 
 
479 aa  173  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  64.34 
 
 
373 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  63.64 
 
 
492 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  24.97 
 
 
1122 aa  153  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  55.2 
 
 
890 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.86 
 
 
933 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  54.92 
 
 
634 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  55.65 
 
 
417 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  51.94 
 
 
732 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  53.03 
 
 
1207 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  52 
 
 
446 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  49.17 
 
 
452 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  55.56 
 
 
489 aa  121  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.81 
 
 
1072 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  54.76 
 
 
492 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  49.61 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  50.39 
 
 
384 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  44.6 
 
 
589 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  51.69 
 
 
558 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  48.25 
 
 
603 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  50 
 
 
469 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  44.44 
 
 
368 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.59 
 
 
627 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.24 
 
 
498 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  48.03 
 
 
451 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  50.41 
 
 
461 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  48.76 
 
 
472 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  47.1 
 
 
490 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  46.38 
 
 
801 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  42.02 
 
 
426 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.68 
 
 
493 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  41.3 
 
 
414 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  46.72 
 
 
374 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  45.3 
 
 
423 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  43.85 
 
 
709 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  47.9 
 
 
468 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  43.33 
 
 
568 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  43.95 
 
 
391 aa  99.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  47.01 
 
 
497 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  38.66 
 
 
522 aa  97.4  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  34.41 
 
 
547 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  44.44 
 
 
548 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  42.06 
 
 
1128 aa  94.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  47.93 
 
 
380 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  37.82 
 
 
488 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  39.01 
 
 
165 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  39.26 
 
 
567 aa  87.8  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  45.53 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.35 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.51 
 
 
531 aa  84.7  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.46 
 
 
476 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.6 
 
 
580 aa  82.4  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  37.1 
 
 
642 aa  81.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  41.43 
 
 
574 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  41.32 
 
 
1577 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  37.17 
 
 
496 aa  77.8  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.84 
 
 
815 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  38.14 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  45.24 
 
 
474 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.7 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  30.13 
 
 
726 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  36.29 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  38.33 
 
 
653 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  32.33 
 
 
597 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  36.92 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  35.76 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.03 
 
 
794 aa  68.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  29.33 
 
 
688 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.75 
 
 
494 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 
571 aa  66.6  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  34.81 
 
 
382 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  35.37 
 
 
425 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  33.56 
 
 
497 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  32.21 
 
 
1016 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  34.97 
 
 
2031 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  33.8 
 
 
166 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  33.87 
 
 
436 aa  62.4  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.86 
 
 
503 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  37.3 
 
 
495 aa  61.6  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  33.61 
 
 
358 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  40.51 
 
 
468 aa  62  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.1 
 
 
648 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  66.67 
 
 
494 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.38 
 
 
672 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  45.78 
 
 
982 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  34.53 
 
 
186 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  33.33 
 
 
1413 aa  58.9  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  32.28 
 
 
644 aa  58.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  30.58 
 
 
275 aa  58.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  25.93 
 
 
481 aa  57.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  36.13 
 
 
483 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  33.07 
 
 
691 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.51 
 
 
737 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  28.48 
 
 
262 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  43.04 
 
 
401 aa  54.7  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  39.02 
 
 
824 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  33.33 
 
 
459 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>