117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6476 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  100 
 
 
166 aa  338  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  42.01 
 
 
186 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  33.8 
 
 
801 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  38.82 
 
 
794 aa  60.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  45.45 
 
 
469 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.58 
 
 
803 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  40.26 
 
 
426 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.68 
 
 
489 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  26.58 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.53 
 
 
516 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.56 
 
 
933 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.31 
 
 
500 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  30.19 
 
 
479 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.58 
 
 
1072 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.88 
 
 
476 aa  54.7  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
423 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  33.33 
 
 
547 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  37.35 
 
 
567 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  27.56 
 
 
474 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  30.72 
 
 
373 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  29.55 
 
 
374 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  33.6 
 
 
461 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  30.65 
 
 
801 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.37 
 
 
493 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  26.87 
 
 
436 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  29.03 
 
 
487 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  29.93 
 
 
492 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  35.9 
 
 
824 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  32.32 
 
 
943 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  28.47 
 
 
535 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  28.83 
 
 
384 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.73 
 
 
494 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 
709 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  30.46 
 
 
1207 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  30.19 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  38.16 
 
 
452 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  38.16 
 
 
496 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.96 
 
 
489 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  30.43 
 
 
806 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  33.72 
 
 
571 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.09 
 
 
672 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.2 
 
 
498 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  42.67 
 
 
391 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  31.11 
 
 
414 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  29.86 
 
 
492 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  31.71 
 
 
451 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.34 
 
 
1016 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  30.08 
 
 
890 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  32.14 
 
 
558 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  35.53 
 
 
801 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  28.79 
 
 
634 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  30.43 
 
 
806 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  30.43 
 
 
806 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  30.43 
 
 
806 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  30.43 
 
 
806 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  30.43 
 
 
806 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 
806 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 
806 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  32.28 
 
 
239 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  35.53 
 
 
472 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  35.79 
 
 
380 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  28.68 
 
 
568 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.87 
 
 
982 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.56 
 
 
507 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  32.29 
 
 
644 aa  47.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  29.47 
 
 
491 aa  47.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  38.27 
 
 
488 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  32.14 
 
 
412 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  28.57 
 
 
548 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  30.97 
 
 
445 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  35.9 
 
 
468 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  36.78 
 
 
647 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.63 
 
 
648 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  31.25 
 
 
603 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  34.21 
 
 
490 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  35 
 
 
589 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  38.27 
 
 
522 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  31.06 
 
 
732 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.33 
 
 
497 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  30.43 
 
 
493 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  30.11 
 
 
748 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  34.15 
 
 
840 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  29.76 
 
 
497 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.85 
 
 
627 aa  44.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  31.82 
 
 
863 aa  44.3  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  28.36 
 
 
858 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  30 
 
 
240 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  28.26 
 
 
427 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  26.67 
 
 
368 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  31.46 
 
 
495 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  28.36 
 
 
858 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  28.36 
 
 
858 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  28.36 
 
 
805 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  28.36 
 
 
807 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  28.36 
 
 
800 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  28.36 
 
 
800 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  35.53 
 
 
358 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  27.59 
 
 
576 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  30.59 
 
 
663 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.7 
 
 
756 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>