118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4031 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  100 
 
 		 531 aa  1080    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  55.54 
 
 		 580 aa  605  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6989  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.35 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4760  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.86 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.68587  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  38.02 
 
 		 566 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26040  hypothetical protein  33.08 
 
 		 396 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2627  hypothetical protein  33.09 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  62.07 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  51.41 
 
 		 522 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  49.3 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  26.34 
 
 		 884 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2956  hypothetical protein  26.6 
 
 		 411 aa  103  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  37.02 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 391 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  44.35 
 
 		 497 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  29.45 
 
 		 791 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  27.01 
 
 		 726 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  40 
 
 		 492 aa  90.1  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  37.29 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.46 
 
 		 1072 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  37.07 
 
 		 492 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  40 
 
 		 426 aa  86.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  38.14 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  36.11 
 
 		 890 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  37.72 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.37 
 
 		 933 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  36.29 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.29 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  35.51 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  39.02 
 
 		 634 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  38.14 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  35.71 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  35.96 
 
 		 801 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  36.75 
 
 		 603 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.13 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  31.69 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  38.14 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  30.82 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.14 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  37.29 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  36.44 
 
 		 801 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  31.72 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  37.19 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  38.21 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  35.77 
 
 		 568 aa  76.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  34.96 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  33.06 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  35.65 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  37.01 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  33.04 
 
 		 1207 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  32.26 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  34.43 
 
 		 732 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.5 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  33.91 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.43 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  33.04 
 
 		 1128 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  34.21 
 
 		 373 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.29 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  36.97 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  34.4 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.56 
 
 		 581 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  29.69 
 
 		 1567 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  31.03 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  31.4 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.85 
 
 		 474 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  34.59 
 
 		 1577 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.48 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.23 
 
 		 794 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  28.97 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  31.78 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.11 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  30.6 
 
 		 1016 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.84 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 674 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  30.66 
 
 		 1259 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  26.03 
 
 		 642 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  33.02 
 
 		 644 aa  53.5  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  40.79 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  31.58 
 
 		 574 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0982  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.65 
 
 		 815 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.16 
 
 		 672 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.63 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 358 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.14 
 
 		 756 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  29.71 
 
 		 806 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  29.71 
 
 		 806 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  29.71 
 
 		 806 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 806 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  30.89 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  29.71 
 
 		 806 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  29.71 
 
 		 806 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 806 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  31.48 
 
 		 165 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  33.8 
 
 		 663 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  24.59 
 
 		 2073 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  31.15 
 
 		 576 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>