139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3796 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  67.17 
 
 		 548 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  100 
 
 		 597 aa  1184    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  48.4 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  44.91 
 
 		 567 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  42.83 
 
 		 535 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  40.34 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  49.74 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  45.57 
 
 		 408 aa  323  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  48.61 
 
 		 413 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  41.88 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  46.48 
 
 		 693 aa  313  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  43.77 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  45.18 
 
 		 471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  42.67 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  43.3 
 
 		 399 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  42.97 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  37.31 
 
 		 574 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  39.33 
 
 		 408 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  36.04 
 
 		 558 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  37.44 
 
 		 411 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  38.75 
 
 		 727 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  37.78 
 
 		 850 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  33.85 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  30.02 
 
 		 532 aa  193  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  29.95 
 
 		 677 aa  190  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  33.26 
 
 		 631 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  30.61 
 
 		 658 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.26 
 
 		 533 aa  175  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  36.74 
 
 		 320 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 434 aa  174  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 589 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  30.45 
 
 		 636 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  30.56 
 
 		 640 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  31.99 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.78 
 
 		 445 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  30.81 
 
 		 441 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  29.1 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.44 
 
 		 612 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  26.16 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  26.67 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  29.06 
 
 		 427 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  25.97 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  26.49 
 
 		 737 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  28.3 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  30.41 
 
 		 587 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  28.63 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  27.46 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  27.59 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.23 
 
 		 435 aa  105  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  40.94 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  25.51 
 
 		 424 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  24.33 
 
 		 469 aa  94  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  38.84 
 
 		 374 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.84 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  39.32 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  39.55 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  36.51 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  39.84 
 
 		 368 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  39.34 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  32.56 
 
 		 801 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  33.33 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  33.07 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.95 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.28 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  33.06 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  35.65 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.47 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  32.33 
 
 		 801 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  33.06 
 
 		 805 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  33.06 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  33.06 
 
 		 858 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  33.06 
 
 		 800 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.06 
 
 		 858 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.06 
 
 		 858 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  33.06 
 
 		 800 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  32.54 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  40.17 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  31.78 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.09 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.45 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.4 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  35.34 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  36.22 
 
 		 516 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 1072 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  34.43 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  34.81 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  31.4 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  30.65 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  28.08 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 522 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  31.9 
 
 		 890 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  40 
 
 		 358 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  29.35 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  30.17 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.75 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.97 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.7 
 
 		 933 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>