81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2597 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 403 aa  836    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  63.61 
 
 		 408 aa  561  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  49.51 
 
 		 411 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  54.36 
 
 		 407 aa  438  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  51.34 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  52.4 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  47.83 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  47.06 
 
 		 535 aa  362  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  47.93 
 
 		 547 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  48.48 
 
 		 541 aa  352  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  45.36 
 
 		 567 aa  338  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  47.27 
 
 		 693 aa  335  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  44.61 
 
 		 604 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  43.51 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  45.06 
 
 		 548 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  43.77 
 
 		 597 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.77 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  41.28 
 
 		 558 aa  272  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  40.45 
 
 		 850 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  40.9 
 
 		 727 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  40.26 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  34.94 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  35.53 
 
 		 640 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  37.82 
 
 		 574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  39.4 
 
 		 320 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  34.45 
 
 		 677 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  34.83 
 
 		 658 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  37.5 
 
 		 631 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 532 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  37.95 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  31.24 
 
 		 535 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  29.83 
 
 		 469 aa  192  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  31.12 
 
 		 533 aa  189  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  32.73 
 
 		 636 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.3 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  27.79 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  27.31 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  27.15 
 
 		 737 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  27.92 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  26.54 
 
 		 589 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  29.65 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  26.09 
 
 		 612 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  28.34 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  25.38 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  26.01 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.91 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  25.27 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  27.59 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  24.89 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  25.95 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  24.56 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  38.04 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 699 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  35.37 
 
 		 649 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  31.18 
 
 		 700 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.96 
 
 		 733 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  21.21 
 
 		 1172 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 713 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  32.58 
 
 		 729 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  30 
 
 		 719 aa  49.7  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  29.35 
 
 		 728 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  32.56 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  30.69 
 
 		 675 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  31.03 
 
 		 701 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  30.3 
 
 		 657 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  32.56 
 
 		 729 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  28.09 
 
 		 818 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 701 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.22 
 
 		 699 aa  47  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.46 
 
 		 743 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  31.03 
 
 		 713 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  29.21 
 
 		 714 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  30.34 
 
 		 734 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.07 
 
 		 674 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.37 
 
 		 684 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  28.09 
 
 		 714 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  31.87 
 
 		 723 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1025  raffinose synthase  33.75 
 
 		 685 aa  43.5  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0334443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  32.95 
 
 		 733 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  30.34 
 
 		 730 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>