54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0053 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  100 
 
 
424 aa  845    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  62.01 
 
 
442 aa  512  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  61.73 
 
 
445 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  61.79 
 
 
427 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  59.95 
 
 
450 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  60.32 
 
 
440 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  57.11 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  52.06 
 
 
435 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  46.73 
 
 
433 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  51.46 
 
 
587 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  44.94 
 
 
446 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  42.15 
 
 
453 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  43.45 
 
 
445 aa  322  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  28.28 
 
 
583 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.43 
 
 
589 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.57 
 
 
737 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  28.87 
 
 
612 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  28.48 
 
 
535 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  27.34 
 
 
532 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  25.69 
 
 
533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  27.99 
 
 
387 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  28.37 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  26.77 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  24.83 
 
 
535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  25.58 
 
 
677 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  23.91 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  25.69 
 
 
658 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  22.58 
 
 
604 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  28.47 
 
 
693 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.42 
 
 
548 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  27.05 
 
 
541 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  27.03 
 
 
568 aa  99.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  24.83 
 
 
408 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  25.58 
 
 
567 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  23.52 
 
 
547 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  25.51 
 
 
597 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  23.91 
 
 
535 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  27 
 
 
408 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  23.62 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  26.99 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  24.56 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  24.94 
 
 
640 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  24.94 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  25.29 
 
 
727 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  24.34 
 
 
574 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  23.43 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  22.64 
 
 
631 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  21.15 
 
 
469 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  23.3 
 
 
636 aa  56.6  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  23.93 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  23.37 
 
 
850 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  22.64 
 
 
892 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  30.6 
 
 
701 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  22.99 
 
 
320 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>