61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1677 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  100 
 
 
408 aa  843    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  58.71 
 
 
407 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  54.79 
 
 
403 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  51.82 
 
 
408 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  48.81 
 
 
471 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  49.25 
 
 
399 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  47.62 
 
 
411 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  49.74 
 
 
693 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  47.41 
 
 
604 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  49.59 
 
 
567 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  46.67 
 
 
535 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  48.15 
 
 
541 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  45.45 
 
 
387 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  45.77 
 
 
547 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  45.57 
 
 
597 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  45.82 
 
 
548 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  45.79 
 
 
558 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  42.46 
 
 
568 aa  302  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  37.41 
 
 
727 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  37.03 
 
 
413 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  38.85 
 
 
850 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  34.15 
 
 
574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  36.08 
 
 
535 aa  229  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  34 
 
 
640 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  36.27 
 
 
631 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  34.76 
 
 
535 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  34.22 
 
 
532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  33.89 
 
 
658 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  32.01 
 
 
636 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  40.28 
 
 
320 aa  192  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  31.52 
 
 
533 aa  189  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  30.43 
 
 
469 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  30.62 
 
 
677 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  34.97 
 
 
434 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.3 
 
 
583 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.49 
 
 
589 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.07 
 
 
612 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.03 
 
 
445 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.57 
 
 
737 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  27.48 
 
 
433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  29.12 
 
 
441 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  31.81 
 
 
587 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  27.77 
 
 
446 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  26.34 
 
 
453 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  28.12 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  26.35 
 
 
442 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  25.93 
 
 
445 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  26.03 
 
 
427 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  27.02 
 
 
440 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  24.83 
 
 
424 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.88 
 
 
435 aa  96.3  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  25.37 
 
 
469 aa  92.8  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  25.55 
 
 
1172 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  33.7 
 
 
657 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  27.71 
 
 
700 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  32.46 
 
 
684 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.82 
 
 
683 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  26.42 
 
 
938 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.21 
 
 
699 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  36.11 
 
 
743 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  31.11 
 
 
734 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>