55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2733 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  909    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  52.46 
 
 
446 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  56.84 
 
 
587 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  51.18 
 
 
453 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  52.35 
 
 
427 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  52.14 
 
 
450 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  46.73 
 
 
424 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  46.88 
 
 
445 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  47.45 
 
 
442 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  47.85 
 
 
445 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  44.02 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  46.15 
 
 
469 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  43.61 
 
 
435 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  29.38 
 
 
583 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.84 
 
 
535 aa  192  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  30.34 
 
 
535 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  31.53 
 
 
533 aa  189  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  31.22 
 
 
737 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.71 
 
 
589 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  28.97 
 
 
532 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  29.2 
 
 
387 aa  166  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  30.02 
 
 
441 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  31.06 
 
 
612 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  26.62 
 
 
604 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  27.46 
 
 
471 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  27.48 
 
 
408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  27.92 
 
 
658 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  26.56 
 
 
677 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  27.75 
 
 
407 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  27.91 
 
 
693 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.63 
 
 
548 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  27.79 
 
 
403 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  26.89 
 
 
408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  27.57 
 
 
541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  26.16 
 
 
597 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  26.12 
 
 
568 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  25.61 
 
 
411 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  26.12 
 
 
535 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  26.7 
 
 
567 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  24.01 
 
 
558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  24.67 
 
 
727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  24.5 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  25.11 
 
 
850 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  25 
 
 
547 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  24.89 
 
 
636 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  24.07 
 
 
631 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  23.13 
 
 
640 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  22.84 
 
 
413 aa  97.8  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  22.27 
 
 
574 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  23.42 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  21.96 
 
 
1172 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  20.51 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  21.97 
 
 
320 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  21.37 
 
 
938 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  23.74 
 
 
824 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>