85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2129 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  100 
 
 
407 aa  831    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  58.71 
 
 
408 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  56.2 
 
 
403 aa  435  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  52.71 
 
 
408 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  51.13 
 
 
399 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  49.75 
 
 
604 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  51.82 
 
 
471 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  51.98 
 
 
567 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  47.06 
 
 
411 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  50.8 
 
 
693 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  49.61 
 
 
541 aa  353  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  46.84 
 
 
387 aa  339  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  49.74 
 
 
597 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  46.07 
 
 
535 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  46.44 
 
 
547 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  48.45 
 
 
548 aa  328  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  44.39 
 
 
568 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  46.67 
 
 
558 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  40.57 
 
 
727 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.41 
 
 
574 aa  255  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  40.31 
 
 
413 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  37.94 
 
 
640 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  37.38 
 
 
535 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  39.24 
 
 
850 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  34.65 
 
 
532 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  36.56 
 
 
658 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  34.77 
 
 
535 aa  225  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  36.08 
 
 
631 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  34.53 
 
 
533 aa  212  9e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  39.57 
 
 
320 aa  210  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  33.89 
 
 
677 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  37.77 
 
 
434 aa  201  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  29.54 
 
 
469 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  31.57 
 
 
636 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  31.16 
 
 
583 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  31.78 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.57 
 
 
445 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.49 
 
 
589 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.47 
 
 
737 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  27.55 
 
 
446 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.18 
 
 
612 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  27.75 
 
 
433 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  29.6 
 
 
427 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  31.39 
 
 
587 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  28.91 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  29.08 
 
 
450 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  25.86 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  28.25 
 
 
445 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  26.77 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.74 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  28.73 
 
 
440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  26.33 
 
 
469 aa  97.1  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  33.73 
 
 
700 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  34.78 
 
 
734 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  32.67 
 
 
657 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  32.58 
 
 
699 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.01 
 
 
683 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.21 
 
 
699 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  27.49 
 
 
684 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  34.15 
 
 
649 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  30.53 
 
 
728 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  31.07 
 
 
530 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  33.65 
 
 
675 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  30.34 
 
 
818 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  33.71 
 
 
733 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.46 
 
 
733 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  30.53 
 
 
768 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  29.41 
 
 
701 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  22.09 
 
 
1172 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 
713 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.26 
 
 
719 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.21 
 
 
688 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  30.34 
 
 
714 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  45.83 
 
 
684 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.85 
 
 
674 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  28.09 
 
 
726 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  29.21 
 
 
729 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  26.11 
 
 
938 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  34.78 
 
 
669 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  29.21 
 
 
714 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  28.09 
 
 
709 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  31.4 
 
 
729 aa  43.1  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  31.4 
 
 
713 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  28.26 
 
 
729 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  27.38 
 
 
824 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>