63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0715 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  100 
 
 
532 aa  1105    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  50.2 
 
 
535 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  48.66 
 
 
535 aa  508  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  48.39 
 
 
658 aa  482  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  47.41 
 
 
677 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  43.06 
 
 
533 aa  419  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  35.57 
 
 
471 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  34.65 
 
 
407 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  34.22 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  33.41 
 
 
403 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  33.18 
 
 
399 aa  200  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  32.18 
 
 
604 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  35.09 
 
 
535 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  30.81 
 
 
568 aa  193  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.58 
 
 
548 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  32.62 
 
 
411 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  33.09 
 
 
387 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  31.46 
 
 
597 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 
693 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  30.59 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  32.45 
 
 
541 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  30.79 
 
 
547 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.41 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  29.63 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  29.69 
 
 
583 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  31.9 
 
 
589 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  28.97 
 
 
433 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  31.02 
 
 
558 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  29.86 
 
 
446 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  30.61 
 
 
567 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  27.14 
 
 
574 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  28.12 
 
 
442 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  28.24 
 
 
427 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.64 
 
 
737 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  28.57 
 
 
440 aa  148  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  32.39 
 
 
587 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  29.52 
 
 
727 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  26.79 
 
 
631 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  30.71 
 
 
441 aa  143  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.1 
 
 
612 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  27.13 
 
 
450 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  26.92 
 
 
850 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  27.04 
 
 
636 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  26.3 
 
 
445 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  27.34 
 
 
424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  28.21 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  25.35 
 
 
640 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.81 
 
 
435 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  25.5 
 
 
413 aa  123  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  28.27 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  23.06 
 
 
469 aa  94.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.4 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.85 
 
 
3563 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  29.47 
 
 
430 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 
616 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  32.1 
 
 
631 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.24 
 
 
1272 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  26.32 
 
 
1172 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38421  predicted protein  30 
 
 
559 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452022  hitchhiker  0.000596343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  35.14 
 
 
1869 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.88 
 
 
887 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  26.21 
 
 
1030 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1025  raffinose synthase  27.1 
 
 
685 aa  43.9  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0334443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>