64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1839 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  100 
 
 
535 aa  1116    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  59.52 
 
 
535 aa  628  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  50.2 
 
 
532 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  48.72 
 
 
658 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  46.39 
 
 
677 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  45.04 
 
 
533 aa  440  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  35.93 
 
 
471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  35.63 
 
 
387 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  34.77 
 
 
407 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  34.76 
 
 
408 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  35.83 
 
 
548 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  33.65 
 
 
597 aa  211  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  33.64 
 
 
399 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 
535 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  32.48 
 
 
568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  31.85 
 
 
541 aa  197  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  31.24 
 
 
403 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  30.34 
 
 
433 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.67 
 
 
547 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  31.23 
 
 
604 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  31.87 
 
 
693 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  30.11 
 
 
408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  31.79 
 
 
583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  30.88 
 
 
567 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  28.67 
 
 
411 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  30.28 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.21 
 
 
445 aa  173  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30.77 
 
 
558 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.95 
 
 
589 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  28.71 
 
 
636 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  29.77 
 
 
850 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  29.4 
 
 
727 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.28 
 
 
737 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  28.11 
 
 
427 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  27.94 
 
 
446 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  28.5 
 
 
413 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  27.99 
 
 
631 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  28.35 
 
 
440 aa  146  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  27.23 
 
 
612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  28.3 
 
 
441 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  27.86 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  25.06 
 
 
640 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  27.83 
 
 
442 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  26.52 
 
 
445 aa  133  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  26.13 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  27.45 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  29.62 
 
 
587 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.63 
 
 
435 aa  125  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  26.38 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  24.83 
 
 
424 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  24.05 
 
 
469 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.08 
 
 
320 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  24.16 
 
 
1172 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  34.48 
 
 
430 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  32.17 
 
 
3563 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  39.39 
 
 
1991 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.97 
 
 
887 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  26.47 
 
 
731 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  25.85 
 
 
938 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  32.1 
 
 
631 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  45.45 
 
 
3542 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 
616 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1025  raffinose synthase  34.12 
 
 
685 aa  44.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0334443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  28.74 
 
 
824 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>