64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2412 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 631 aa  1266    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  58.89 
 
 		 636 aa  728    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  36.01 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  33.18 
 
 		 541 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  36.27 
 
 		 408 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.22 
 
 		 567 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  36.08 
 
 		 407 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  34.05 
 
 		 693 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  33.89 
 
 		 408 aa  208  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  37.5 
 
 		 403 aa  207  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  35.1 
 
 		 558 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  31.96 
 
 		 535 aa  203  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.98 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  31.9 
 
 		 387 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  32.52 
 
 		 604 aa  191  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  34.11 
 
 		 597 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.25 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  32.7 
 
 		 850 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  32.35 
 
 		 411 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  32.91 
 
 		 399 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  32.9 
 
 		 574 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  29.46 
 
 		 727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  32.75 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  27.99 
 
 		 535 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  29.33 
 
 		 658 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  29.28 
 
 		 535 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  30.81 
 
 		 677 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  26.79 
 
 		 532 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  29.66 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  27.97 
 
 		 533 aa  133  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  28.79 
 
 		 640 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  30.2 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  30.48 
 
 		 320 aa  120  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  24.54 
 
 		 583 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  26.65 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  24.07 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  26.85 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.32 
 
 		 445 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  24.83 
 
 		 450 aa  95.1  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  28.06 
 
 		 587 aa  94.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  22.03 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  25.55 
 
 		 612 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  23.09 
 
 		 446 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  25.07 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  24.07 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  24.33 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  21.4 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  23.97 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  40.62 
 
 		 693 aa  67.8  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  40.62 
 
 		 970 aa  67.4  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  22.64 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.53 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  35.24 
 
 		 737 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  32.2 
 
 		 1069 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  27.69 
 
 		 2142 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 601 aa  52.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.81 
 
 		 1392 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  25.98 
 
 		 1193 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  30 
 
 		 440 aa  51.6  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.25 
 
 		 1424 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  31.78 
 
 		 812 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  35.51 
 
 		 1193 aa  47.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  29.46 
 
 		 1236 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  26.77 
 
 		 1465 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>