64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1187 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  100 
 
 
533 aa  1107    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  45.28 
 
 
535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  45.04 
 
 
535 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  41.63 
 
 
532 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  40.57 
 
 
658 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  39.73 
 
 
677 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  34.53 
 
 
407 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  30.7 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  31.53 
 
 
433 aa  190  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  31.52 
 
 
408 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  31.12 
 
 
403 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.89 
 
 
445 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  30.8 
 
 
399 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  30.46 
 
 
471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  29.93 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  32.07 
 
 
693 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 
604 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  31.4 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  29.77 
 
 
408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.26 
 
 
597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.73 
 
 
548 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  31.13 
 
 
567 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  29.48 
 
 
547 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  29.85 
 
 
387 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.91 
 
 
583 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.47 
 
 
589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  27.42 
 
 
453 aa  163  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  30.63 
 
 
427 aa  163  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.72 
 
 
737 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  27.48 
 
 
411 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  29.3 
 
 
446 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30 
 
 
558 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  29.33 
 
 
440 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  26.93 
 
 
636 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  28.24 
 
 
727 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  27.59 
 
 
574 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  32.25 
 
 
587 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  28.31 
 
 
450 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  26.83 
 
 
850 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  26.64 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  25.69 
 
 
424 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  27.97 
 
 
631 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  27.77 
 
 
445 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  27.62 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  29.85 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  29.18 
 
 
469 aa  124  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  27.03 
 
 
612 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  26.12 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  23.37 
 
 
640 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.37 
 
 
435 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  21.22 
 
 
469 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.3 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  33.75 
 
 
631 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  20.8 
 
 
1172 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 
616 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  25.4 
 
 
505 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  30.23 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  22.9 
 
 
679 aa  45.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  23.39 
 
 
578 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  30 
 
 
579 aa  43.9  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  29.07 
 
 
555 aa  43.9  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.28 
 
 
683 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  25.67 
 
 
684 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  33.33 
 
 
649 aa  43.5  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>