64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3220 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  100 
 
 
535 aa  1096    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  59.52 
 
 
535 aa  628  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  48.66 
 
 
532 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  50.2 
 
 
658 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  48.24 
 
 
677 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  45.83 
 
 
533 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  37.38 
 
 
407 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  36.28 
 
 
471 aa  240  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  34.94 
 
 
403 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  36.08 
 
 
408 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  34.5 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  33.56 
 
 
399 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  32.87 
 
 
408 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.94 
 
 
411 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  35.09 
 
 
568 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  35.61 
 
 
548 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  35.24 
 
 
597 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  33.19 
 
 
541 aa  204  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  33.82 
 
 
535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  35.01 
 
 
693 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  31.54 
 
 
604 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  31.84 
 
 
433 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  32.63 
 
 
547 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.05 
 
 
567 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.97 
 
 
445 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  31.35 
 
 
583 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  31.43 
 
 
558 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  31.83 
 
 
727 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  32.33 
 
 
589 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  30.02 
 
 
453 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  32.19 
 
 
427 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.84 
 
 
737 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  31.66 
 
 
440 aa  156  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  34.99 
 
 
587 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  29.28 
 
 
631 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  29.68 
 
 
574 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  27.48 
 
 
446 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  29.15 
 
 
850 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  30.04 
 
 
445 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  31.79 
 
 
636 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  30.13 
 
 
413 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  30.81 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  28.48 
 
 
424 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  28.87 
 
 
441 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  27.25 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  28.44 
 
 
442 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.62 
 
 
612 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  26.83 
 
 
640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  28.65 
 
 
469 aa  117  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.28 
 
 
435 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  23.76 
 
 
469 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  26.18 
 
 
320 aa  87  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  30.25 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  31.3 
 
 
824 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44 
 
 
887 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  28.19 
 
 
1879 aa  53.5  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  43.94 
 
 
1991 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  45 
 
 
3563 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  39.19 
 
 
2802 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  38.81 
 
 
1869 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1025  raffinose synthase  39.51 
 
 
685 aa  47  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0334443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.28 
 
 
1848 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 
616 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  41.43 
 
 
3911 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>