15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1025 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1025  raffinose synthase  100 
 
 
685 aa  1396    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0334443 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  44.74 
 
 
649 aa  496  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1496  alpha-galactosidase  29.07 
 
 
620 aa  190  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0517  raffinose synthase  26.96 
 
 
675 aa  170  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.780547  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_744  predicted protein  25.74 
 
 
675 aa  126  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0353558 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03874  raffinose synthase protein Sip1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08250)  28.12 
 
 
863 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00640  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 
742 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0777  hypothetical protein  26.44 
 
 
708 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  25.24 
 
 
535 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  34.67 
 
 
579 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  29.73 
 
 
578 aa  48.1  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  24.36 
 
 
679 aa  45.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  23 
 
 
535 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  32 
 
 
579 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  27.1 
 
 
532 aa  44.3  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>