57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2742 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  100 
 
 
440 aa  865    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  60.32 
 
 
424 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  56.45 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  58.89 
 
 
442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  52.84 
 
 
469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  60.39 
 
 
445 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  56.32 
 
 
450 aa  441  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  51.03 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  44.02 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  48.41 
 
 
587 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  41.78 
 
 
446 aa  339  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  43.14 
 
 
453 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  41.97 
 
 
445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  29.72 
 
 
583 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.36 
 
 
535 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  28.57 
 
 
532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  28.35 
 
 
535 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  29.33 
 
 
533 aa  146  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.07 
 
 
589 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  26.48 
 
 
677 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  28.05 
 
 
612 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  27.98 
 
 
737 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  25.05 
 
 
604 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  30.26 
 
 
387 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  28.73 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  25.39 
 
 
658 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  28.44 
 
 
441 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  25.06 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  28.42 
 
 
597 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.05 
 
 
548 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  25 
 
 
535 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  25.93 
 
 
568 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  27.02 
 
 
408 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  24.18 
 
 
547 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  26.29 
 
 
567 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  27.13 
 
 
727 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  26.01 
 
 
403 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  25.87 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  24.28 
 
 
541 aa  93.2  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  27.14 
 
 
693 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  26.21 
 
 
574 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  25.16 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  21.27 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  26.18 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  24.66 
 
 
558 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  23.08 
 
 
636 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  22.71 
 
 
640 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  23.94 
 
 
850 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  23.81 
 
 
320 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  22.19 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  30 
 
 
631 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  22.58 
 
 
469 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  48.78 
 
 
562 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  32.11 
 
 
684 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  43.48 
 
 
782 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.42 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  26.56 
 
 
723 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>