81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2514 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 
723 aa  1467    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  29.88 
 
 
675 aa  241  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.57 
 
 
674 aa  237  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  32.68 
 
 
679 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  26.31 
 
 
684 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.33 
 
 
683 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  23.7 
 
 
708 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  23.7 
 
 
708 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  23.7 
 
 
708 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  27.88 
 
 
699 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  21.33 
 
 
713 aa  102  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  23.21 
 
 
722 aa  97.8  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  26.58 
 
 
701 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  24.15 
 
 
714 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  25.97 
 
 
530 aa  95.1  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  24.63 
 
 
724 aa  94  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  23.01 
 
 
716 aa  90.5  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  23.88 
 
 
714 aa  90.9  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.97 
 
 
707 aa  90.1  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  24.57 
 
 
708 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  24.57 
 
 
708 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  26.06 
 
 
709 aa  89  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  25.89 
 
 
715 aa  87.4  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  23.95 
 
 
713 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  25.36 
 
 
730 aa  85.5  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  23.83 
 
 
736 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  27.42 
 
 
733 aa  85.1  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  24.8 
 
 
728 aa  85.1  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  23.11 
 
 
726 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  23.65 
 
 
723 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  24.36 
 
 
726 aa  83.2  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  21.93 
 
 
700 aa  82  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  25.87 
 
 
721 aa  82  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  24.72 
 
 
747 aa  80.9  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  22.62 
 
 
726 aa  80.9  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  24.31 
 
 
743 aa  80.5  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  24.81 
 
 
657 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  25.08 
 
 
700 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  26.4 
 
 
723 aa  79.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
709 aa  79  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  22.22 
 
 
730 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.01 
 
 
719 aa  78.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  19.58 
 
 
727 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  24.02 
 
 
734 aa  77.8  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  24.88 
 
 
727 aa  77  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  25.69 
 
 
701 aa  75.5  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  22.52 
 
 
750 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.32 
 
 
735 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  20.72 
 
 
740 aa  75.1  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.86 
 
 
718 aa  74.3  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  24.26 
 
 
724 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  24.84 
 
 
726 aa  73.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  21.87 
 
 
818 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  25.54 
 
 
740 aa  73.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  21.29 
 
 
739 aa  72.4  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.4 
 
 
688 aa  71.2  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
729 aa  70.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  23.92 
 
 
729 aa  70.1  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.77 
 
 
729 aa  70.5  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  31.16 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  25.66 
 
 
729 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  27.2 
 
 
707 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 
733 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  22.02 
 
 
669 aa  64.7  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  24.88 
 
 
768 aa  64.7  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  25.31 
 
 
747 aa  62.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  25.3 
 
 
718 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  21.06 
 
 
722 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  22.25 
 
 
706 aa  62  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  22.27 
 
 
774 aa  61.2  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.07 
 
 
733 aa  61.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  23.24 
 
 
734 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  23.49 
 
 
704 aa  56.6  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  26.07 
 
 
562 aa  55.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  23.75 
 
 
730 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.19 
 
 
699 aa  55.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  26.2 
 
 
679 aa  54.3  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  22.09 
 
 
729 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  26.47 
 
 
552 aa  50.8  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  26.47 
 
 
552 aa  50.8  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  21.45 
 
 
732 aa  50.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>