64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6874 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 441 aa  886    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  54.89 
 
 		 583 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  45.5 
 
 		 737 aa  342  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  43.02 
 
 		 589 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  36.95 
 
 		 612 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  31.67 
 
 		 604 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  32.01 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  32.29 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  30.02 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.33 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  29.1 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  32.32 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  30.82 
 
 		 568 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  33.43 
 
 		 587 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  31.55 
 
 		 658 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  29.32 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.98 
 
 		 548 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.34 
 
 		 597 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  29.89 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  30.69 
 
 		 408 aa  156  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  30.68 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  31.26 
 
 		 693 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  29.19 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.86 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  30.71 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  28.54 
 
 		 535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  29.1 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  32.03 
 
 		 727 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  29.95 
 
 		 567 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  32.28 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  30.11 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  30.52 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30.43 
 
 		 558 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.03 
 
 		 411 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  28.1 
 
 		 403 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  28.54 
 
 		 541 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.1 
 
 		 533 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.05 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  28.34 
 
 		 677 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  32.06 
 
 		 574 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  29.43 
 
 		 850 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  28.65 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  30.52 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  28.44 
 
 		 440 aa  127  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  27.79 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  27.21 
 
 		 631 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  25.96 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  23.6 
 
 		 636 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  25.37 
 
 		 469 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  27.97 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  27.71 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  24.58 
 
 		 1172 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  22.73 
 
 		 938 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.64 
 
 		 824 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 684 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  25.26 
 
 		 727 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  24.3 
 
 		 657 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  26.99 
 
 		 768 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.4 
 
 		 683 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  26.29 
 
 		 723 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  26.04 
 
 		 733 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  23.44 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  21.1 
 
 		 892 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>