87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1987 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  100 
 
 		 782 aa  1576    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  33.9 
 
 		 679 aa  262  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  33.64 
 
 		 552 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  33.41 
 
 		 552 aa  233  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 562 aa  230  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  28.28 
 
 		 555 aa  226  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  35.96 
 
 		 578 aa  203  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.07 
 
 		 510 aa  190  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  28.17 
 
 		 1020 aa  190  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  40.5 
 
 		 429 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  32.45 
 
 		 484 aa  180  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  33.53 
 
 		 579 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  30.28 
 
 		 579 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  29.37 
 
 		 505 aa  144  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  26.34 
 
 		 824 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  29.67 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  26.68 
 
 		 734 aa  70.5  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  28.88 
 
 		 713 aa  62.4  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  36.08 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  29.73 
 
 		 818 aa  58.9  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  28.81 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  27.27 
 
 		 729 aa  58.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  30.92 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  30.92 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  29.63 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  29.63 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  30.92 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  33.8 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  24.06 
 
 		 722 aa  57.4  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.1 
 
 		 733 aa  56.2  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 727 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  31.78 
 
 		 727 aa  55.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  26.62 
 
 		 743 aa  55.8  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.44 
 
 		 718 aa  55.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  29.66 
 
 		 733 aa  55.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  32.54 
 
 		 728 aa  54.3  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  24.81 
 
 		 730 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  30.7 
 
 		 732 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  27.52 
 
 		 726 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.87 
 
 		 684 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  28.1 
 
 		 892 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  33.08 
 
 		 709 aa  53.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  32.33 
 
 		 709 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  36.14 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  31.91 
 
 		 713 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  29.85 
 
 		 714 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  30.95 
 
 		 774 aa  52.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  32.47 
 
 		 726 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.17 
 
 		 729 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  28.11 
 
 		 740 aa  52  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.21 
 
 		 729 aa  51.6  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  22.05 
 
 		 737 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.32 
 
 		 700 aa  51.6  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  27.71 
 
 		 740 aa  51.2  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  34.18 
 
 		 714 aa  51.2  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  35.21 
 
 		 708 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  35.21 
 
 		 708 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  26.19 
 
 		 666 aa  50.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  30.56 
 
 		 694 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  28.32 
 
 		 716 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  28.91 
 
 		 723 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  26.04 
 
 		 430 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.33 
 
 		 707 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  26.24 
 
 		 795 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  25.68 
 
 		 445 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  27.17 
 
 		 729 aa  48.5  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  30.77 
 
 		 701 aa  48.5  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  24.83 
 
 		 699 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  26.83 
 
 		 722 aa  47  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  26.73 
 
 		 775 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 733 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.47 
 
 		 435 aa  46.6  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  43.48 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  30.38 
 
 		 707 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  30.43 
 
 		 706 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 715 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  30 
 
 		 701 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  31.36 
 
 		 679 aa  45.8  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  28.68 
 
 		 747 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 616 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.68 
 
 		 674 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.07 
 
 		 688 aa  45.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 799 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  26.23 
 
 		 675 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  30.6 
 
 		 718 aa  44.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  25.07 
 
 		 589 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  26.19 
 
 		 757 aa  44.3  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>