69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3892 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  100 
 
 
387 aa  798    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  46.84 
 
 
407 aa  339  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  45.45 
 
 
408 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  42.97 
 
 
408 aa  319  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  43.49 
 
 
471 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  41.9 
 
 
411 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  44.07 
 
 
399 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  43.51 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  44.42 
 
 
604 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  44.15 
 
 
567 aa  311  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  44.56 
 
 
541 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  47.32 
 
 
535 aa  302  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  42.97 
 
 
597 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  43.3 
 
 
693 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  40.31 
 
 
568 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  43.13 
 
 
548 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  41.3 
 
 
547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  37.12 
 
 
727 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  38.27 
 
 
413 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  35.63 
 
 
535 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  34.5 
 
 
535 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  33.33 
 
 
558 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.52 
 
 
850 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  33.42 
 
 
640 aa  206  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  32.07 
 
 
658 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  35.08 
 
 
574 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  38.59 
 
 
320 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  31.6 
 
 
677 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  31.9 
 
 
631 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  33.09 
 
 
532 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  33.84 
 
 
434 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  31.12 
 
 
636 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.36 
 
 
445 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  28.12 
 
 
469 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  29.85 
 
 
533 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  29.2 
 
 
433 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  30 
 
 
445 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  30.22 
 
 
442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  30.98 
 
 
450 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  30.27 
 
 
441 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  28.18 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.47 
 
 
737 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  29 
 
 
446 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  30.67 
 
 
427 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.07 
 
 
435 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  29.08 
 
 
583 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  32.87 
 
 
587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  30.26 
 
 
440 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  27.99 
 
 
424 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  28.71 
 
 
612 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  26.95 
 
 
589 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  29.83 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  31.46 
 
 
699 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 
657 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  28.66 
 
 
656 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  45.28 
 
 
684 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  24.84 
 
 
734 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.04 
 
 
683 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.46 
 
 
699 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  30.85 
 
 
713 aa  46.6  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  22.97 
 
 
675 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  32.63 
 
 
684 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0866  raffinose synthase  32.1 
 
 
649 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.93 
 
 
733 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  27.08 
 
 
700 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.38 
 
 
674 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  29.07 
 
 
818 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  30 
 
 
733 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  26.09 
 
 
701 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>