67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7223 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 583 aa  1174    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  54.42 
 
 		 441 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  47.65 
 
 		 589 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  46.74 
 
 		 737 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  35.82 
 
 		 612 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  29.38 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  30.18 
 
 		 604 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  30.95 
 
 		 446 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  34.1 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  32.75 
 
 		 535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  32.4 
 
 		 587 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  31.79 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.84 
 
 		 445 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  30.09 
 
 		 471 aa  178  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  32.71 
 
 		 568 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  30.95 
 
 		 658 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  31.17 
 
 		 407 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.35 
 
 		 535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  28.28 
 
 		 424 aa  173  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  29.72 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  30.81 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  29.69 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.26 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  29.41 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  28.96 
 
 		 453 aa  170  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.91 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  30.56 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  28.97 
 
 		 677 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  32.09 
 
 		 727 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  29.72 
 
 		 440 aa  160  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  31.74 
 
 		 597 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.03 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  29.81 
 
 		 558 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  32.58 
 
 		 408 aa  153  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  32.5 
 
 		 567 aa  151  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  30.05 
 
 		 693 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  28.92 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  32.01 
 
 		 413 aa  150  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  29.27 
 
 		 541 aa  147  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  26.44 
 
 		 411 aa  140  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  29.91 
 
 		 574 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  30.15 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  26.82 
 
 		 399 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  27.31 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  28.92 
 
 		 850 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  29.08 
 
 		 387 aa  134  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  24.52 
 
 		 636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  24.32 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  24.3 
 
 		 640 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  44.12 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  24.75 
 
 		 469 aa  94.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  27.27 
 
 		 434 aa  93.2  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  45.45 
 
 		 580 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  24.48 
 
 		 1172 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.99 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  25.38 
 
 		 938 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.6 
 
 		 790 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 892 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.01 
 
 		 824 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  25.76 
 
 		 505 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  24.29 
 
 		 733 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  23.84 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  27.32 
 
 		 475 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.9 
 
 		 718 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  25.16 
 
 		 727 aa  44.3  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  25.29 
 
 		 782 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  26.45 
 
 		 729 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>