176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1665 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 567 aa  1155    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  56.02 
 
 		 535 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  51.95 
 
 		 547 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  46.22 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  59.29 
 
 		 693 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  43.46 
 
 		 597 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  51.98 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  50.81 
 
 		 541 aa  363  6e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  49.59 
 
 		 408 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  48.92 
 
 		 471 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  48.15 
 
 		 408 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  39.3 
 
 		 568 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  45.36 
 
 		 403 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  38.31 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  44.85 
 
 		 604 aa  332  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  42.41 
 
 		 411 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  39.39 
 
 		 574 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  42.93 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  44.59 
 
 		 387 aa  312  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  46.17 
 
 		 727 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  32.5 
 
 		 589 aa  233  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  39.11 
 
 		 850 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  38.58 
 
 		 413 aa  227  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  43.43 
 
 		 320 aa  224  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  34.22 
 
 		 631 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  34.2 
 
 		 640 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  36.42 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  38.34 
 
 		 434 aa  197  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  34.53 
 
 		 636 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  33.81 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  30.94 
 
 		 677 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  33.5 
 
 		 658 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  30.88 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.48 
 
 		 533 aa  173  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  30.61 
 
 		 532 aa  163  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  32.5 
 
 		 583 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.81 
 
 		 612 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  29.81 
 
 		 441 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  26.02 
 
 		 737 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  27.54 
 
 		 446 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  48.39 
 
 		 469 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  27.3 
 
 		 433 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  31.79 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  29.11 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.95 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  48.76 
 
 		 801 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  45.31 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  28.61 
 
 		 445 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  46.77 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  27.96 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  47.62 
 
 		 603 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.99 
 
 		 493 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  45.24 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  27.2 
 
 		 442 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.97 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.74 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  41.94 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  41.18 
 
 		 801 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  41.18 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  24.01 
 
 		 453 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  42.07 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  42.11 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  41.32 
 
 		 468 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  42.86 
 
 		 497 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  41.33 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.21 
 
 		 435 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  28.4 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  41.13 
 
 		 451 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  25.58 
 
 		 424 aa  97.8  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  40.32 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40 
 
 		 634 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  26.29 
 
 		 440 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.16 
 
 		 489 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  42.28 
 
 		 803 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  38.06 
 
 		 492 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  40 
 
 		 801 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  38.17 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  42.22 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  37.31 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  29.2 
 
 		 890 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.25 
 
 		 933 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.71 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.82 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  35 
 
 		 1207 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  36.88 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.67 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  37.91 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.99 
 
 		 436 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.48 
 
 		 1072 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  35.11 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  36.64 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 709 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  35.66 
 
 		 391 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  31.2 
 
 		 426 aa  73.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  37.9 
 
 		 165 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  37.69 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  34.06 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  29.68 
 
 		 488 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  34.91 
 
 		 1128 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.08 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>