166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6907 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  100 
 
 		 469 aa  951    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  67.86 
 
 		 489 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  37.69 
 
 		 494 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.1 
 
 		 491 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.15 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  39.13 
 
 		 497 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  64.41 
 
 		 558 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  64.66 
 
 		 801 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  58.99 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  61.98 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  62.9 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  50 
 
 		 801 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  60.48 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  64.23 
 
 		 535 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  56.49 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  55.88 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  58.87 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  59.68 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  58.4 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  57.26 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  57.38 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  57.6 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  58.06 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  52.45 
 
 		 589 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  52.89 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  50.75 
 
 		 548 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  54.4 
 
 		 500 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  55.65 
 
 		 568 aa  136  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  53.08 
 
 		 603 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  48.39 
 
 		 567 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  49.18 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  50 
 
 		 801 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  47.37 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  43.86 
 
 		 634 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.03 
 
 		 1072 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  40.91 
 
 		 803 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40.58 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.3 
 
 		 933 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  41.23 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  40.94 
 
 		 597 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  40.87 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  44.88 
 
 		 373 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 		 391 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  39.68 
 
 		 516 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  42.5 
 
 		 709 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  46.49 
 
 		 732 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  41.23 
 
 		 890 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  48.67 
 
 		 452 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.47 
 
 		 627 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  43.36 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  40.16 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  40.62 
 
 		 165 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  44.83 
 
 		 574 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  41.27 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  38.6 
 
 		 1207 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  40.87 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  44.25 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  37.72 
 
 		 1128 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.31 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.91 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.31 
 
 		 580 aa  83.6  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  37.17 
 
 		 358 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  33.08 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.72 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.09 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32.76 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  38.51 
 
 		 824 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  37.8 
 
 		 1016 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  35.77 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  35.4 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.82 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  34.15 
 
 		 653 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.2 
 
 		 648 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  30.83 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1577 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.68 
 
 		 756 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  43.04 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  33.6 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  34.4 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  34.4 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.3 
 
 		 815 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  34.45 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1139 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 571 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.08 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  31.75 
 
 		 571 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 858 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  30.4 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  30.4 
 
 		 807 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  30.4 
 
 		 858 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  30.4 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  30.4 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  32.03 
 
 		 1100 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.6 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  30.71 
 
 		 1413 aa  61.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 858 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  31.58 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>