151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7491 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  100 
 
 		 417 aa  842    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1606  Alginate lyase 2  60.34 
 
 		 274 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139119  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  68.67 
 
 		 732 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  77.24 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  63.22 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.85 
 
 		 1072 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2401  hypothetical protein  45.73 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  66.67 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  59.02 
 
 		 492 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  59.68 
 
 		 634 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  54.14 
 
 		 890 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2582  hypothetical protein  36.14 
 
 		 370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0495255  hitchhiker  0.0081508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  56.25 
 
 		 801 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  51.8 
 
 		 1207 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  48.59 
 
 		 516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.06 
 
 		 815 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.16 
 
 		 933 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  47.15 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0508  lyase, putative  37.39 
 
 		 223 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3376  lyase, putative  37.72 
 
 		 222 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4213  hypothetical protein  36.56 
 
 		 223 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  45.77 
 
 		 803 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49320  hypothetical protein  37 
 
 		 223 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52458  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5015  lyase, putative  35.93 
 
 		 223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3605  lyase, putative  37.99 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.903035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.12 
 
 		 627 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5256  lyase, putative  33.91 
 
 		 222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  44.52 
 
 		 479 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0463  hypothetical protein  35.22 
 
 		 227 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  42.48 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2102  hypothetical protein  33.91 
 
 		 229 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00164411  normal  0.0561114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  39.72 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1666  hypothetical protein  34.33 
 
 		 226 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.398713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  48.7 
 
 		 489 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41500  putative lyase  32.91 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  43.09 
 
 		 1128 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3520  hypothetical protein  32.48 
 
 		 231 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  41.55 
 
 		 589 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  39.27 
 
 		 709 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  47.46 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  44.07 
 
 		 603 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  40 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3057  hypothetical protein  30.53 
 
 		 238 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0328593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  37.78 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  42.34 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  39.32 
 
 		 558 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  43.36 
 
 		 469 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.17 
 
 		 498 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  45.9 
 
 		 391 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  42.98 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  43.33 
 
 		 801 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  42.5 
 
 		 490 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.86 
 
 		 493 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11483  hypothetical protein  28.63 
 
 		 301 aa  87.4  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  42.15 
 
 		 568 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  42.24 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  43 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  40 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  35.56 
 
 		 522 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  40 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  40.83 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  39.13 
 
 		 801 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  39.66 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.34 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  39.72 
 
 		 574 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  39.17 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  38.84 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  37.66 
 
 		 567 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  29.29 
 
 		 611 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.01 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  39.83 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3286  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  29.03 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00739048  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  35.94 
 
 		 165 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  32.3 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  32.12 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.67 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.48 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  36.89 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.24 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.22 
 
 		 644 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23960  alginate lyase  29.49 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31810  alginate lyase  30.3 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  27.05 
 
 		 1554 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3336  Alginate lyase 2  29.24 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  30.58 
 
 		 1556 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  44 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.39 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.4 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  30.07 
 
 		 642 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11528  putative alginate lyase  26.1 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.187327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.25 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  33.1 
 
 		 2031 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  41.25 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  29.57 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  43.68 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  31.76 
 
 		 576 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.59 
 
 		 494 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  35.54 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  41.18 
 
 		 982 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>