149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4641 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  100 
 
 
574 aa  1154    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  40.68 
 
 
535 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  38.46 
 
 
568 aa  356  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  41.54 
 
 
547 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  41.22 
 
 
548 aa  345  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  39.51 
 
 
567 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  37.66 
 
 
597 aa  314  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  41.54 
 
 
727 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  35.3 
 
 
558 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  39.32 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  39.65 
 
 
693 aa  263  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  35.48 
 
 
408 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  37.9 
 
 
541 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  38.93 
 
 
604 aa  249  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  34.55 
 
 
471 aa  249  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  36.63 
 
 
408 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  36.63 
 
 
403 aa  236  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  36.71 
 
 
411 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  33.67 
 
 
399 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.21 
 
 
850 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  31.51 
 
 
589 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  36.79 
 
 
413 aa  210  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  35.49 
 
 
387 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  32.15 
 
 
636 aa  190  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  31.7 
 
 
631 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  30.82 
 
 
640 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  29.86 
 
 
535 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  28.07 
 
 
532 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  31.98 
 
 
434 aa  159  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  30.16 
 
 
658 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.41 
 
 
583 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  28.25 
 
 
533 aa  153  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  26.96 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  27.19 
 
 
677 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  27.91 
 
 
737 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  31.22 
 
 
441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  29.97 
 
 
320 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  27.54 
 
 
469 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  45.81 
 
 
634 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.11 
 
 
612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.49 
 
 
445 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  26.46 
 
 
445 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  25.87 
 
 
450 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  26.99 
 
 
427 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  45.16 
 
 
414 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.67 
 
 
1072 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  26.15 
 
 
442 aa  101  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  45.93 
 
 
368 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  26.41 
 
 
440 aa  98.2  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  46.55 
 
 
489 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  43.48 
 
 
492 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.24 
 
 
933 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  44.96 
 
 
391 aa  94.7  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  41.09 
 
 
709 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  24.84 
 
 
424 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  22.91 
 
 
433 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  41.01 
 
 
801 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  43.85 
 
 
492 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  23.5 
 
 
453 aa  90.5  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  42.97 
 
 
603 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.44 
 
 
435 aa  89.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  44.83 
 
 
469 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  41.73 
 
 
490 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  40.34 
 
 
497 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  39.68 
 
 
426 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  44 
 
 
472 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  43.7 
 
 
468 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.5 
 
 
493 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  42.31 
 
 
732 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  45 
 
 
461 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  39.55 
 
 
1128 aa  87  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  40.44 
 
 
384 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.83 
 
 
498 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.55 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  23.28 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.5 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  41.94 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  42.5 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  43.44 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  42.61 
 
 
801 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  24.74 
 
 
587 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  25.59 
 
 
469 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  41.35 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  35.93 
 
 
890 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  41.43 
 
 
801 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  36.8 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  40.91 
 
 
1207 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  42.5 
 
 
380 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  36.8 
 
 
522 aa  77.4  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  40.15 
 
 
417 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.79 
 
 
627 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  36.48 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.53 
 
 
803 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  38.24 
 
 
479 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  31.31 
 
 
642 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  38.46 
 
 
446 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.66 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  38.18 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.46 
 
 
815 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.61 
 
 
423 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>