53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0514 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 		 435 aa  884    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  52.06 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  51.18 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  51.03 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  58.43 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  47.17 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  48.28 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  49.76 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  47.34 
 
 		 587 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  40.99 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  43.61 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  42.5 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.66 
 
 		 445 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  27.03 
 
 		 583 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 604 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  31.07 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  26.35 
 
 		 589 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  26.59 
 
 		 441 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.48 
 
 		 548 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  25.63 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  25.81 
 
 		 532 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  24.83 
 
 		 471 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  25.74 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  26 
 
 		 737 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  29.28 
 
 		 535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  27.74 
 
 		 568 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  25.94 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  25.37 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  25.23 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  23.78 
 
 		 677 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  23.94 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  24.21 
 
 		 567 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  23.99 
 
 		 658 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  23.91 
 
 		 612 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  23.88 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  23.91 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  24.12 
 
 		 727 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  25.45 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  22.83 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  24.94 
 
 		 693 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  25.11 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  23.62 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  23.56 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  21.4 
 
 		 631 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  22.65 
 
 		 640 aa  77  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  22.7 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  22.08 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  23.46 
 
 		 558 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  22.81 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  24.64 
 
 		 320 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  21.73 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  24.47 
 
 		 782 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  21.04 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>