130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1327 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  100 
 
 		 732 aa  1472    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  57.4 
 
 		 918 aa  628  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.77 
 
 		 962 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.87 
 
 		 734 aa  594  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  52.44 
 
 		 850 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.19 
 
 		 722 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.36 
 
 		 648 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  45.68 
 
 		 2117 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  45.28 
 
 		 640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  45.25 
 
 		 627 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.55 
 
 		 755 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45 
 
 		 537 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.79 
 
 		 940 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  42.43 
 
 		 645 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  44.06 
 
 		 844 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  45.94 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  40.55 
 
 		 640 aa  402  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.43 
 
 		 652 aa  399  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  39.38 
 
 		 622 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  35.3 
 
 		 726 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  36.81 
 
 		 722 aa  310  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  87.7 
 
 		 452 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  69.14 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  68.29 
 
 		 384 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  70.73 
 
 		 1072 aa  184  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  69.23 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  58.46 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  58.06 
 
 		 634 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.23 
 
 		 933 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  51.52 
 
 		 801 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  49.25 
 
 		 890 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  53.85 
 
 		 516 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  47.59 
 
 		 803 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  51.59 
 
 		 1207 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.62 
 
 		 815 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  46.72 
 
 		 426 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.25 
 
 		 627 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  45.6 
 
 		 1128 aa  108  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  46.76 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  46.4 
 
 		 373 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  44.72 
 
 		 414 aa  105  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  47.83 
 
 		 489 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  46.61 
 
 		 423 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  46.49 
 
 		 469 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 709 aa  93.6  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  39.17 
 
 		 496 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  43.06 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  41.53 
 
 		 603 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.83 
 
 		 498 aa  90.9  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  45.08 
 
 		 391 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  41.53 
 
 		 558 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  42.15 
 
 		 568 aa  89  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  39.34 
 
 		 589 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  40.83 
 
 		 461 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  40.85 
 
 		 574 aa  87.8  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.33 
 
 		 493 aa  87.8  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  41.32 
 
 		 472 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  40.83 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  40 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  40 
 
 		 801 aa  84  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  42.74 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  37.7 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  38.6 
 
 		 801 aa  80.9  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  40 
 
 		 497 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  38.33 
 
 		 368 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.03 
 
 		 489 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  37.39 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  39.17 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  38.84 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  41.23 
 
 		 468 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  35.06 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  37.12 
 
 		 165 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.5 
 
 		 500 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.94 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.43 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.87 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  35.43 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.9 
 
 		 482 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  40.91 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  32.41 
 
 		 2031 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  34.15 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  30.87 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  37.21 
 
 		 2615 aa  58.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  29.94 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  35 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  28.49 
 
 		 569 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  31.25 
 
 		 597 aa  55.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.29 
 
 		 474 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  29.53 
 
 		 576 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  31.97 
 
 		 794 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  38.05 
 
 		 824 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 465 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  40.96 
 
 		 186 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.45 
 
 		 858 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  32.39 
 
 		 239 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  31.25 
 
 		 1100 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  32.8 
 
 		 382 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>