189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4930 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  100 
 
 
801 aa  1622    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  45.31 
 
 
722 aa  555  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  93.01 
 
 
490 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  32.99 
 
 
839 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  96.09 
 
 
472 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  76.54 
 
 
493 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  88.89 
 
 
498 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  32.73 
 
 
1011 aa  224  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  29.68 
 
 
627 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  76.74 
 
 
461 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  27.52 
 
 
832 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  76.19 
 
 
451 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  74.8 
 
 
547 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  74.6 
 
 
489 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  28.47 
 
 
788 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  29.53 
 
 
791 aa  194  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  74.6 
 
 
468 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  27.24 
 
 
951 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  26.3 
 
 
965 aa  191  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  36.57 
 
 
1049 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  70.87 
 
 
500 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  70.87 
 
 
380 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  26.68 
 
 
838 aa  183  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  29.17 
 
 
648 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  26.88 
 
 
580 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  64.29 
 
 
374 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  60.66 
 
 
558 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  61.42 
 
 
492 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  50 
 
 
469 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  60 
 
 
801 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  58.4 
 
 
535 aa  151  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  60 
 
 
603 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  60.33 
 
 
589 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  58.4 
 
 
489 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  51.77 
 
 
368 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  44.78 
 
 
548 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  47.2 
 
 
497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  25.79 
 
 
2286 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  44.7 
 
 
492 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  49.21 
 
 
568 aa  110  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  45.83 
 
 
634 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  44.19 
 
 
803 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  41.18 
 
 
567 aa  105  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  46.38 
 
 
801 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  41.32 
 
 
890 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  42.86 
 
 
373 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  42.19 
 
 
479 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.37 
 
 
933 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  35.43 
 
 
494 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  35.66 
 
 
516 aa  98.2  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  37.29 
 
 
426 aa  97.4  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  24.58 
 
 
563 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  38.17 
 
 
391 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.67 
 
 
1072 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  36.09 
 
 
709 aa  91.3  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  41.01 
 
 
574 aa  91.3  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  40.32 
 
 
642 aa  90.9  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  36.13 
 
 
414 aa  90.9  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  42.97 
 
 
446 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  38.82 
 
 
1207 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  27.92 
 
 
1121 aa  88.2  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  43.33 
 
 
384 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  42.37 
 
 
417 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.16 
 
 
789 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  41.46 
 
 
165 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.84 
 
 
627 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  38.84 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  40 
 
 
732 aa  84.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  36.84 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  37.19 
 
 
465 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.9 
 
 
1016 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  43.31 
 
 
824 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.44 
 
 
531 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.71 
 
 
488 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  37.12 
 
 
1128 aa  76.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  32.56 
 
 
597 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35.04 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  32.12 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  33.88 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.53 
 
 
494 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.57 
 
 
476 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  32.06 
 
 
358 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.06 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.44 
 
 
815 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.07 
 
 
503 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  28.87 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.1 
 
 
580 aa  67  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  28.97 
 
 
1577 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  37.84 
 
 
459 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.23 
 
 
695 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.15 
 
 
756 aa  65.1  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.43 
 
 
520 aa  64.3  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  28.39 
 
 
493 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  44.87 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 
495 aa  63.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  30.99 
 
 
411 aa  63.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  32.68 
 
 
320 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  31.1 
 
 
491 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.46 
 
 
943 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30 
 
 
794 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>