209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3108 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  100 
 
 		 368 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  62.67 
 
 		 374 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  48.23 
 
 		 401 aa  315  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  65.35 
 
 		 349 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  66.35 
 
 		 261 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  44.44 
 
 		 373 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  60.87 
 
 		 241 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  50.96 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  61.6 
 
 		 558 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  43.56 
 
 		 681 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  56.49 
 
 		 469 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  33.88 
 
 		 358 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  52.45 
 
 		 603 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  56.2 
 
 		 472 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  55.04 
 
 		 490 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  50.35 
 
 		 801 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.34 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  54.26 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  54.24 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  52 
 
 		 492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  56.52 
 
 		 801 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.53 
 
 		 528 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  52.89 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.82 
 
 		 498 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  53.72 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  51.56 
 
 		 461 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  48.94 
 
 		 589 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  55.28 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.58 
 
 		 489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  47.73 
 
 		 548 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  52.99 
 
 		 497 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.07 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  49.59 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  33.58 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  35.68 
 
 		 759 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  39 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  32.78 
 
 		 1234 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  45.24 
 
 		 803 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  46.22 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  37.2 
 
 		 1282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  45.24 
 
 		 567 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  44.44 
 
 		 801 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  44.83 
 
 		 634 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  42.96 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  37.44 
 
 		 688 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  33.48 
 
 		 749 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  34.78 
 
 		 828 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  42.06 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  41.3 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  45.74 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07158  conserved hypothetical protein  33.65 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.014159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  44.27 
 
 		 709 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  47.24 
 
 		 574 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  32.76 
 
 		 329 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  30.67 
 
 		 921 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  31.71 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  34.56 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  40.54 
 
 		 494 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.59 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  28.37 
 
 		 576 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  39.66 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.08 
 
 		 627 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.04 
 
 		 933 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  44.83 
 
 		 1207 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.34 
 
 		 1072 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  34.46 
 
 		 890 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  33.7 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.35 
 
 		 476 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  32.85 
 
 		 255 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  36.88 
 
 		 1128 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  35.71 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  34.84 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  39.34 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  38.84 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  38.35 
 
 		 1016 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  37.39 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.5 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  38.33 
 
 		 732 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  29.03 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  39.83 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  29.49 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  39.84 
 
 		 597 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  34.4 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.71 
 
 		 756 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  32.52 
 
 		 869 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  37.07 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  32.35 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04573  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 943 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  31.86 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  38.76 
 
 		 824 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  38.46 
 
 		 653 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.63 
 
 		 580 aa  69.7  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>