63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2554 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 612 aa  1248    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  35.75 
 
 		 583 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  41.14 
 
 		 737 aa  309  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  40.68 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  36.1 
 
 		 441 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  25.85 
 
 		 604 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  30.26 
 
 		 408 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  31.06 
 
 		 433 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  29.98 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.96 
 
 		 445 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  29.35 
 
 		 407 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  29.62 
 
 		 453 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  30.16 
 
 		 446 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  30.02 
 
 		 693 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  27.19 
 
 		 535 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  31.94 
 
 		 558 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  29.82 
 
 		 568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  29.95 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  28.7 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  30.43 
 
 		 587 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  30.81 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  30.11 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  29.57 
 
 		 597 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  28.23 
 
 		 424 aa  143  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  29.08 
 
 		 850 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  29.65 
 
 		 535 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  30.02 
 
 		 427 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  28.87 
 
 		 547 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  27.91 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  27.75 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  24.18 
 
 		 677 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  30.31 
 
 		 445 aa  133  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  30.12 
 
 		 450 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  26.07 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  25.73 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  26.2 
 
 		 658 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  27.19 
 
 		 533 aa  131  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  25.84 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  28.76 
 
 		 387 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  27.53 
 
 		 727 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  26.48 
 
 		 403 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  27.46 
 
 		 938 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  28.04 
 
 		 574 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  28.95 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.86 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  26.15 
 
 		 631 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  25.36 
 
 		 1172 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  24.62 
 
 		 636 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  25.18 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  23.74 
 
 		 640 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  38.58 
 
 		 580 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  25.29 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  40.16 
 
 		 892 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  22.53 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.39 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.76 
 
 		 790 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  34.06 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  24.54 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  26.34 
 
 		 679 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  39.06 
 
 		 700 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  30.5 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>