28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1855 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 
892 aa  1840    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  39.94 
 
 
666 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3595  hypothetical protein  26.14 
 
 
731 aa  168  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0030344  hitchhiker  0.000112547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  37.3 
 
 
434 aa  90.9  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  22.69 
 
 
824 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  40.16 
 
 
612 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  34.04 
 
 
583 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  24.38 
 
 
562 aa  67.4  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  37.19 
 
 
580 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  32.84 
 
 
475 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  27.75 
 
 
484 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  28.1 
 
 
782 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 
1000 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  32.33 
 
 
554 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  22.64 
 
 
424 aa  52.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  34.82 
 
 
2073 aa  52.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  26.46 
 
 
589 aa  52  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  31.1 
 
 
815 aa  51.2  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  24.25 
 
 
578 aa  48.5  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2259  Carbohydrate binding family 6  30.22 
 
 
713 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  30.77 
 
 
726 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  25.7 
 
 
610 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  24.61 
 
 
552 aa  45.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  27.64 
 
 
401 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.58 
 
 
809 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  24.28 
 
 
552 aa  44.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  23.43 
 
 
441 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  21.49 
 
 
555 aa  44.3  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>