76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2869 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  100 
 
 
679 aa  1354    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  33.9 
 
 
782 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  38.89 
 
 
552 aa  259  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  38.6 
 
 
552 aa  256  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  42.55 
 
 
510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  36.88 
 
 
429 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  37.78 
 
 
562 aa  224  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  30.39 
 
 
555 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  34.33 
 
 
484 aa  211  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  30.78 
 
 
578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  36.19 
 
 
1020 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  29.64 
 
 
579 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  28.8 
 
 
579 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  30.5 
 
 
505 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  30.6 
 
 
824 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  27.69 
 
 
589 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  26.89 
 
 
818 aa  65.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  30.32 
 
 
694 aa  65.1  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  25.1 
 
 
729 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  23.21 
 
 
740 aa  61.2  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.42 
 
 
733 aa  61.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  23.04 
 
 
739 aa  60.5  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.88 
 
 
684 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  27.45 
 
 
734 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  27.4 
 
 
713 aa  57.4  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  23 
 
 
722 aa  56.6  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  30.05 
 
 
794 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.83 
 
 
718 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  25.15 
 
 
730 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  26.21 
 
 
708 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  26.21 
 
 
708 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  26.21 
 
 
708 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  25.28 
 
 
734 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  28.12 
 
 
530 aa  55.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  27.97 
 
 
700 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  21.6 
 
 
743 aa  54.3  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  26.2 
 
 
723 aa  54.3  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  23.33 
 
 
709 aa  53.9  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  24.77 
 
 
716 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  24.52 
 
 
430 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  22.5 
 
 
709 aa  52  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  29.49 
 
 
631 aa  51.2  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  29.45 
 
 
733 aa  50.8  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  26.34 
 
 
612 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  20.64 
 
 
568 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
616 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  24.88 
 
 
726 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  26.28 
 
 
714 aa  49.3  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  25.3 
 
 
701 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5646  hypothetical protein  24.5 
 
 
666 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  22.91 
 
 
729 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  26.21 
 
 
768 aa  48.1  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.5 
 
 
699 aa  48.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.32 
 
 
799 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.89 
 
 
707 aa  47.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  27.61 
 
 
727 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  28 
 
 
726 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.81 
 
 
765 aa  47.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  25.64 
 
 
714 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  31.46 
 
 
795 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  26.87 
 
 
774 aa  47  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  21.76 
 
 
729 aa  46.6  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 
799 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  21.57 
 
 
502 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  26.98 
 
 
579 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  20.56 
 
 
755 aa  45.8  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  23.66 
 
 
701 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  22.9 
 
 
533 aa  45.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.22 
 
 
683 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_744  predicted protein  36.84 
 
 
675 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0353558 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  26.86 
 
 
736 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  22.69 
 
 
729 aa  45.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  26.86 
 
 
723 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  26.92 
 
 
760 aa  44.3  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  23.71 
 
 
699 aa  43.9  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.21 
 
 
700 aa  43.9  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>