167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4855 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  100 
 
 		 503 aa  1031    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  41.77 
 
 		 334 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4673  lipolytic protein G-D-S-L family  40.91 
 
 		 331 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  64.96 
 
 		 569 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.31 
 
 		 401 aa  124  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  43.48 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  36.03 
 
 		 571 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 814 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.71 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  35.17 
 
 		 957 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  37.66 
 
 		 392 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  36.71 
 
 		 563 aa  96.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  35.86 
 
 		 884 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  39.86 
 
 		 615 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  39.29 
 
 		 1413 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.69 
 
 		 472 aa  93.6  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.25 
 
 		 436 aa  93.6  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  39.39 
 
 		 497 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.81 
 
 		 695 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  38.97 
 
 		 430 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  34.97 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  38.52 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  32.98 
 
 		 425 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  36.3 
 
 		 691 aa  87.4  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1139 aa  87.4  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  34.29 
 
 		 503 aa  87.4  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  32.35 
 
 		 566 aa  87  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.43 
 
 		 494 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  34.01 
 
 		 1259 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  32.37 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  26.32 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  28.52 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.3 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  33.83 
 
 		 943 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  36.96 
 
 		 1187 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  30.22 
 
 		 737 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.08 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  31.85 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.83 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  34.96 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.91 
 
 		 963 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.5 
 
 		 648 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.08 
 
 		 672 aa  77  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.29 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.21 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25.93 
 
 		 514 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.9 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  32.03 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1254  GDSL family lipase  28.15 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000525756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  32.33 
 
 		 897 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.81 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  35.37 
 
 		 1141 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  29.41 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  30 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.57 
 
 		 2073 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  32.87 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25.32 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  34.07 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  30.22 
 
 		 982 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.65 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.25 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  34.85 
 
 		 589 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  34.07 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  34.53 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  33.85 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.88 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  34.65 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  25.21 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  33.07 
 
 		 801 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.94 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.08 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  33.86 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.79 
 
 		 863 aa  67.8  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  46.25 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  33.6 
 
 		 824 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.65 
 
 		 498 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  38.46 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  31.54 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  41.77 
 
 		 603 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  34 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  34.46 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  34 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  34 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  34.46 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34.46 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  32.03 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.75 
 
 		 756 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  41.18 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  32.23 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4327  GDSL family lipase  26.29 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  31.16 
 
 		 771 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1778  hypothetical protein  25.62 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.91 
 
 		 1016 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>