19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2370 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  100 
 
 		 360 aa  757    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  35.47 
 
 		 814 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  36.87 
 
 		 436 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4327  GDSL family lipase  31.1 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  32.05 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.32 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0721  hypothetical protein  31.94 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.706774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  28.08 
 
 		 495 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  27.16 
 
 		 545 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4965  GDSL family lipase  28.15 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1254  GDSL family lipase  25.95 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000525756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3143  hypothetical protein  22.44 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  28.9 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1295  lipase/acylhydrolase, putative  28.29 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.336383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1140  GDSL family lipase  28.38 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00178726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  24.63 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2933  acetylxylan esterase  29.09 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00634363  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.46 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0113749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4673  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>