15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1140 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1140  GDSL family lipase  100 
 
 		 385 aa  800    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00178726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1254  GDSL family lipase  28.85 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000525756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 814 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.25 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.89 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0113749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  25.72 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.38 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  23.12 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0721  hypothetical protein  25.56 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.706774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2933  acetylxylan esterase  26.16 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00634363  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4965  GDSL family lipase  22.91 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4327  GDSL family lipase  25.28 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  23.05 
 
 		 545 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  27.11 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>