20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1254 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1254  GDSL family lipase  100 
 
 		 357 aa  741    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000525756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  36.13 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  36.8 
 
 		 814 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  26.72 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0721  hypothetical protein  31.56 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.706774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1140  GDSL family lipase  28.85 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00178726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  25.95 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.02 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2933  acetylxylan esterase  26.82 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00634363  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  25.09 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  27.66 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3143  hypothetical protein  23.37 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4327  GDSL family lipase  25.67 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  22.01 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.31 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0113749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1295  lipase/acylhydrolase, putative  23.38 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.336383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  25.34 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05320  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00620)  24.58 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.426041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4965  GDSL family lipase  26.81 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4673  lipolytic protein G-D-S-L family  24.03 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>