119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2162 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
436 aa  897    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  48.89 
 
 
814 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  36.02 
 
 
402 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.04 
 
 
366 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.87 
 
 
360 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0721  hypothetical protein  36.81 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.706774  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  35.2 
 
 
495 aa  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3143  hypothetical protein  29.77 
 
 
369 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1254  GDSL family lipase  36.13 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000525756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4327  GDSL family lipase  29.64 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  29.85 
 
 
545 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.75 
 
 
366 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0113749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4965  GDSL family lipase  27.51 
 
 
366 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  50 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2933  acetylxylan esterase  30.19 
 
 
208 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00634363  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4673  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
331 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  61.54 
 
 
303 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  26.28 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  52.24 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  26.02 
 
 
503 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  55.88 
 
 
475 aa  77  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  45.24 
 
 
861 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1295  lipase/acylhydrolase, putative  28.29 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.336383  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  38 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1140  GDSL family lipase  25.72 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00178726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  48.57 
 
 
532 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  48.53 
 
 
539 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  46.27 
 
 
725 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  42.86 
 
 
885 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  42.86 
 
 
462 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  38.89 
 
 
848 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  36.08 
 
 
477 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  38.57 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  44.26 
 
 
722 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  40.28 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  40.85 
 
 
895 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 
308 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 
471 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  48.33 
 
 
737 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  41.54 
 
 
524 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  31.48 
 
 
820 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  39.76 
 
 
646 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  37.84 
 
 
900 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  42.03 
 
 
567 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  46.77 
 
 
534 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  41.79 
 
 
873 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  41.94 
 
 
955 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  36.96 
 
 
604 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 
1122 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  41.89 
 
 
757 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  41.27 
 
 
435 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  39.34 
 
 
1015 aa  53.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  43.75 
 
 
732 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.33 
 
 
831 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  41.54 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 
1224 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  37.68 
 
 
922 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  41.94 
 
 
526 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  34.69 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
580 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 
683 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  34.78 
 
 
630 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  36.92 
 
 
577 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  30.58 
 
 
469 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 
591 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  32.32 
 
 
780 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  31.3 
 
 
621 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  39.34 
 
 
536 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 
611 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  36.07 
 
 
746 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  28.89 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1778  hypothetical protein  26.82 
 
 
322 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  39.34 
 
 
541 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  38.1 
 
 
490 aa  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  32.35 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
741 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 
639 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  34.09 
 
 
584 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  37.1 
 
 
949 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 
590 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 
789 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 
951 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  32.84 
 
 
535 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.57 
 
 
511 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  35.21 
 
 
391 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 
477 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  25.69 
 
 
316 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.13 
 
 
350 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 
649 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  27.06 
 
 
600 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
484 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.73 
 
 
710 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.53 
 
 
807 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  44.64 
 
 
874 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  40.68 
 
 
560 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  38.33 
 
 
715 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  36.36 
 
 
552 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  37.97 
 
 
833 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  38.24 
 
 
742 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>