214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3169 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  100 
 
 
545 aa  1073    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  51.05 
 
 
495 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.98 
 
 
366 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0113749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1295  lipase/acylhydrolase, putative  32.7 
 
 
390 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.336383  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  29.51 
 
 
436 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  28 
 
 
402 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
814 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.75 
 
 
366 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  56.04 
 
 
478 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  53.19 
 
 
854 aa  94.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  53.33 
 
 
490 aa  94  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  42.54 
 
 
468 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  48.98 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 
422 aa  90.5  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.85 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  46.43 
 
 
702 aa  85.1  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  45.74 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.25 
 
 
437 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  35.39 
 
 
846 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 
812 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  44.83 
 
 
449 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  48.98 
 
 
673 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40.65 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3143  hypothetical protein  24.68 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  46.81 
 
 
820 aa  77  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  55.29 
 
 
454 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  48.45 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  39.13 
 
 
694 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  42.05 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  46.32 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  45.83 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  39.81 
 
 
493 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  45.24 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  43.75 
 
 
690 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  51.76 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.75 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  38.41 
 
 
792 aa  70.5  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  44.83 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  42.68 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  42.11 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  46.88 
 
 
445 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  36.84 
 
 
900 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  50 
 
 
89 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  44.09 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  41.18 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.24 
 
 
979 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  41.57 
 
 
785 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  39.39 
 
 
400 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.18 
 
 
491 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  36.89 
 
 
925 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  50 
 
 
829 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  40.4 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  33.61 
 
 
609 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  38.71 
 
 
655 aa  66.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.64 
 
 
767 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  40.43 
 
 
353 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  37.86 
 
 
911 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.18 
 
 
469 aa  64.7  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  38.61 
 
 
847 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1307  cellulose-binding family II  39.68 
 
 
175 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.530275  hitchhiker  0.00098691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  40.86 
 
 
746 aa  63.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2933  acetylxylan esterase  25.48 
 
 
208 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00634363  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  43.08 
 
 
756 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  38.95 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  39.36 
 
 
372 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  38.1 
 
 
725 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  42.71 
 
 
2305 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  39.58 
 
 
966 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  30 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4327  GDSL family lipase  27.59 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  30.56 
 
 
674 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  30.56 
 
 
674 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  44.83 
 
 
775 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  40.21 
 
 
366 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  30.56 
 
 
674 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  41 
 
 
360 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  35.85 
 
 
347 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  30.56 
 
 
674 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  38.71 
 
 
744 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  30.56 
 
 
674 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  38.1 
 
 
880 aa  61.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1254  GDSL family lipase  22.01 
 
 
357 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000525756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  39.77 
 
 
913 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  41.57 
 
 
719 aa  60.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  42.86 
 
 
457 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0721  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.706774  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 
778 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 
674 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  38.24 
 
 
743 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  40.45 
 
 
454 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  36.21 
 
 
699 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.46 
 
 
984 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  40.24 
 
 
620 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  43.37 
 
 
597 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  29.63 
 
 
674 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  38.18 
 
 
679 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  42.86 
 
 
423 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  37.04 
 
 
459 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.5 
 
 
2310 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  37.5 
 
 
774 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>