108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2967 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  34.72 
 
 		 691 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  36.03 
 
 		 412 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.36 
 
 		 507 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  35.86 
 
 		 401 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.55 
 
 		 466 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.66 
 
 		 474 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.48 
 
 		 430 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 		 520 aa  86.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  35.29 
 
 		 737 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  34.25 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.1 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  30.15 
 
 		 571 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  31.72 
 
 		 1139 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  33.81 
 
 		 566 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  35.21 
 
 		 560 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  30.07 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.59 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.39 
 
 		 2073 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  32.06 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  32.59 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  29.73 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  32.09 
 
 		 863 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  37.4 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.53 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  32.58 
 
 		 1259 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  31.91 
 
 		 425 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.06 
 
 		 476 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  30.83 
 
 		 982 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  26.67 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29.87 
 
 		 474 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  27.7 
 
 		 1413 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.91 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  40.96 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  32.35 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  33.91 
 
 		 663 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25.93 
 
 		 507 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.54 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  28.47 
 
 		 943 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  26.87 
 
 		 897 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  30.88 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  29.23 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  32.31 
 
 		 489 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  30.37 
 
 		 615 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  28.06 
 
 		 647 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.94 
 
 		 794 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  32.09 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  28.15 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  26.9 
 
 		 664 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  28.17 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.03 
 
 		 756 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  25.56 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  39.76 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.22 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  36.43 
 
 		 1347 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  29.2 
 
 		 789 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  27.21 
 
 		 884 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  25.93 
 
 		 957 aa  55.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  41.27 
 
 		 569 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  31.75 
 
 		 801 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  31.25 
 
 		 634 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.54 
 
 		 695 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  30.53 
 
 		 771 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 368 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  26.12 
 
 		 963 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.63 
 
 		 497 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30.71 
 
 		 558 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  25.93 
 
 		 576 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  29.93 
 
 		 497 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  30.94 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  29.92 
 
 		 824 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  27.66 
 
 		 1187 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  29.92 
 
 		 414 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  37.97 
 
 		 803 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  29.46 
 
 		 488 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  29.06 
 
 		 806 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  29.77 
 
 		 568 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  24.16 
 
 		 648 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  27.67 
 
 		 806 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  27.67 
 
 		 806 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  27.67 
 
 		 806 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  27.67 
 
 		 806 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  27.67 
 
 		 806 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 		 806 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 		 806 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  30.36 
 
 		 748 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  25 
 
 		 1141 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  30.16 
 
 		 522 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  24.21 
 
 		 498 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  32.84 
 
 		 1567 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  30.3 
 
 		 374 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  24.56 
 
 		 1148 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  25.44 
 
 		 1049 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  27.2 
 
 		 618 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.56 
 
 		 548 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  25.44 
 
 		 726 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  35 
 
 		 603 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  29.06 
 
 		 1016 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  27.14 
 
 		 482 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>