177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4363 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 
963 aa  1960    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  32.68 
 
 
678 aa  350  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  32.77 
 
 
667 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  31.83 
 
 
838 aa  337  9e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  32.11 
 
 
677 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  31.59 
 
 
669 aa  310  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  31.79 
 
 
663 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  31.11 
 
 
675 aa  296  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  28.3 
 
 
684 aa  277  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  52.59 
 
 
897 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  53.28 
 
 
771 aa  141  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  31.87 
 
 
737 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  40.88 
 
 
576 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  36.09 
 
 
691 aa  100  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  27.34 
 
 
672 aa  98.6  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  42.65 
 
 
582 aa  97.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.59 
 
 
474 aa  96.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  38 
 
 
503 aa  95.5  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.24 
 
 
507 aa  94.7  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  38.97 
 
 
537 aa  94.7  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  39.13 
 
 
566 aa  93.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  35.07 
 
 
412 aa  91.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  40.3 
 
 
411 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.17 
 
 
466 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  25.78 
 
 
607 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.33 
 
 
520 aa  86.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  25.31 
 
 
659 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  25.31 
 
 
656 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  25.31 
 
 
667 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  25.31 
 
 
656 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  27.54 
 
 
652 aa  84.3  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  27.8 
 
 
647 aa  84  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  30.5 
 
 
571 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.84 
 
 
495 aa  82.8  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.33 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  39.26 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  25.31 
 
 
651 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.03 
 
 
436 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  24.9 
 
 
651 aa  80.1  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  24.9 
 
 
651 aa  79.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  24.49 
 
 
651 aa  79  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.58 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  24.49 
 
 
651 aa  78.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  26.64 
 
 
640 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.58 
 
 
514 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.1 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.91 
 
 
503 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  24.84 
 
 
955 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  36.69 
 
 
789 aa  75.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.27 
 
 
507 aa  75.5  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  35.56 
 
 
618 aa  75.1  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  26.81 
 
 
806 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  26.81 
 
 
806 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  26.81 
 
 
806 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.81 
 
 
806 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  32.33 
 
 
563 aa  74.3  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  26.81 
 
 
806 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  26.81 
 
 
806 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  26.81 
 
 
806 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  24.18 
 
 
638 aa  74.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  24.17 
 
 
602 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  34.84 
 
 
1139 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  31.58 
 
 
491 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  23.93 
 
 
648 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  31.65 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  28.64 
 
 
596 aa  72.4  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  22.81 
 
 
632 aa  72  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  27.27 
 
 
844 aa  71.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  26.42 
 
 
640 aa  71.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  30.71 
 
 
1413 aa  71.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  26.79 
 
 
679 aa  71.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  25.93 
 
 
648 aa  70.5  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  26.83 
 
 
648 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  27.27 
 
 
634 aa  70.1  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  25.12 
 
 
673 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  31.85 
 
 
943 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  22.35 
 
 
647 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  26.53 
 
 
643 aa  69.3  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  23.5 
 
 
680 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  26.42 
 
 
640 aa  68.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  31.65 
 
 
494 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.86 
 
 
507 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.66 
 
 
695 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  26.74 
 
 
620 aa  68.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  26.96 
 
 
640 aa  68.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  34.68 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  30.63 
 
 
957 aa  67.8  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  24.44 
 
 
806 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  22.52 
 
 
656 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  21.61 
 
 
665 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  26.97 
 
 
633 aa  67  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.38 
 
 
884 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  23.81 
 
 
636 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  24.42 
 
 
666 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  23.48 
 
 
644 aa  66.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  27.19 
 
 
655 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  27.27 
 
 
620 aa  66.2  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  22.33 
 
 
684 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32.7 
 
 
497 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.31 
 
 
472 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>