74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0089 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 677 aa  1415    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  66.91 
 
 		 678 aa  988    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  68.47 
 
 		 667 aa  954    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  44.96 
 
 		 684 aa  565  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  44.8 
 
 		 675 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  41.34 
 
 		 838 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  35.85 
 
 		 669 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  36.17 
 
 		 663 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  32.11 
 
 		 963 aa  329  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  25.94 
 
 		 602 aa  97.8  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  27.97 
 
 		 684 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  29.63 
 
 		 680 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  23.88 
 
 		 640 aa  91.3  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  22.57 
 
 		 640 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  24.73 
 
 		 620 aa  88.2  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  22.38 
 
 		 648 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  21.36 
 
 		 665 aa  88.2  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  25.16 
 
 		 596 aa  87.4  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  22.94 
 
 		 647 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  24.73 
 
 		 620 aa  85.5  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  22.8 
 
 		 711 aa  84.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  24.92 
 
 		 652 aa  84  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  23.5 
 
 		 844 aa  84  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  21.25 
 
 		 640 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  24.19 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  27.39 
 
 		 955 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  23.08 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 		 659 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  24.15 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  22.7 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  24.15 
 
 		 667 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  22.69 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  22.69 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  23.08 
 
 		 651 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  22.69 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  24.42 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  26.12 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  26.54 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  21.88 
 
 		 656 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  22.54 
 
 		 672 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  22.77 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  22.34 
 
 		 634 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  24.37 
 
 		 636 aa  72  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  21.83 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  25.07 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  24.92 
 
 		 655 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  21.34 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  27.11 
 
 		 673 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  24.56 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  22.34 
 
 		 638 aa  68.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  21.36 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  23.75 
 
 		 614 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  22.2 
 
 		 1025 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  23.66 
 
 		 800 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  26.05 
 
 		 633 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  23.08 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.2 
 
 		 803 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  24.38 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  25.13 
 
 		 783 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  28.66 
 
 		 771 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  35.71 
 
 		 846 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  25.13 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  24.4 
 
 		 679 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  23.02 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  25.59 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  23.49 
 
 		 617 aa  57  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.87 
 
 		 795 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  22.48 
 
 		 795 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  22.48 
 
 		 795 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  21.98 
 
 		 629 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  24.52 
 
 		 641 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  23.53 
 
 		 792 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  21.46 
 
 		 760 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  25.36 
 
 		 881 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>