71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3545 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  79.91 
 
 		 669 aa  1068    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1348    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  36.17 
 
 		 677 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  36.19 
 
 		 667 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  36.13 
 
 		 678 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  35.56 
 
 		 838 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  34.22 
 
 		 675 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  32.84 
 
 		 684 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.79 
 
 		 963 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  23.2 
 
 		 656 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  23 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  22.51 
 
 		 651 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  28.74 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  22.72 
 
 		 640 aa  84  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  22.26 
 
 		 656 aa  84  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  22.51 
 
 		 651 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  22.51 
 
 		 651 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  27.2 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  22.44 
 
 		 659 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  22.44 
 
 		 667 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  22.51 
 
 		 651 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  23.72 
 
 		 620 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  22.31 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  23.97 
 
 		 620 aa  78.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  21.77 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  26.45 
 
 		 634 aa  73.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  24.19 
 
 		 711 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  25.64 
 
 		 652 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  25.43 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  27 
 
 		 643 aa  69.7  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  26.92 
 
 		 633 aa  68.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  25.71 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  23.68 
 
 		 647 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  21.59 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  25.32 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  25.11 
 
 		 654 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  23.43 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  26.04 
 
 		 844 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  21.11 
 
 		 640 aa  63.9  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  20.33 
 
 		 648 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  29.56 
 
 		 771 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  23.6 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  24.16 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  20.15 
 
 		 686 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  22.73 
 
 		 672 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  22.73 
 
 		 684 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  27.15 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  29.44 
 
 		 629 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  22.71 
 
 		 1025 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  21.62 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  24.49 
 
 		 634 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  23.58 
 
 		 665 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  20.09 
 
 		 673 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  24.21 
 
 		 679 aa  54.3  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  20.68 
 
 		 596 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  27.37 
 
 		 641 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  22.15 
 
 		 638 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  24.88 
 
 		 655 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  20.64 
 
 		 648 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  21.22 
 
 		 648 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  22.07 
 
 		 628 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  29.09 
 
 		 846 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  21.51 
 
 		 955 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  18.99 
 
 		 760 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  21.86 
 
 		 800 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  21.25 
 
 		 646 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  24.46 
 
 		 795 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  21.9 
 
 		 659 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  24.46 
 
 		 795 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.46 
 
 		 795 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  19.72 
 
 		 742 aa  45.4  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>