83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2143 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1348    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  76.16 
 
 		 647 aa  1048    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  49.76 
 
 		 640 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  48.43 
 
 		 648 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  48.33 
 
 		 640 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  45.41 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  40 
 
 		 652 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  43.06 
 
 		 640 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  38.23 
 
 		 656 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  38.59 
 
 		 651 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  38.59 
 
 		 651 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  38.59 
 
 		 651 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  38.59 
 
 		 651 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  38.59 
 
 		 651 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  37.92 
 
 		 656 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  37.77 
 
 		 667 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  37.92 
 
 		 659 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  43.19 
 
 		 636 aa  478  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  42.79 
 
 		 638 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  39.88 
 
 		 659 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  37.87 
 
 		 617 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  36.19 
 
 		 646 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  37.93 
 
 		 620 aa  432  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  37.68 
 
 		 620 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  35.38 
 
 		 655 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  37.16 
 
 		 656 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  36.25 
 
 		 666 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  37.54 
 
 		 634 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  34.29 
 
 		 742 aa  399  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  35.87 
 
 		 628 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  34.55 
 
 		 800 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  33.03 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  35.63 
 
 		 634 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  37.69 
 
 		 647 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  34.53 
 
 		 629 aa  362  1e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  29.66 
 
 		 680 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  29.55 
 
 		 665 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  29.84 
 
 		 673 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  40.36 
 
 		 679 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  34.77 
 
 		 652 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  33.33 
 
 		 686 aa  300  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  31.57 
 
 		 672 aa  300  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  31.38 
 
 		 684 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  35.31 
 
 		 397 aa  264  3e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  30.95 
 
 		 629 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  31.26 
 
 		 643 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  28.92 
 
 		 633 aa  243  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  29.95 
 
 		 643 aa  242  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  29.52 
 
 		 654 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  29.28 
 
 		 643 aa  233  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  28.08 
 
 		 607 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  24.65 
 
 		 602 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  27.36 
 
 		 711 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.89 
 
 		 641 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  27.17 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  22.7 
 
 		 677 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  23.77 
 
 		 667 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  28.46 
 
 		 684 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  27.23 
 
 		 844 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  21.52 
 
 		 1025 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  24.25 
 
 		 614 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  20.81 
 
 		 678 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  25.93 
 
 		 963 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  27.65 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  19.82 
 
 		 955 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  22.69 
 
 		 675 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  25 
 
 		 783 aa  64.7  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  20 
 
 		 765 aa  64.7  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  21.46 
 
 		 760 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  29.93 
 
 		 771 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.69 
 
 		 803 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  23.28 
 
 		 838 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  21.18 
 
 		 669 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  20.64 
 
 		 663 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  26.29 
 
 		 846 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  28.32 
 
 		 749 aa  50.8  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  26.79 
 
 		 744 aa  47.8  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  19.35 
 
 		 795 aa  47.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  23.1 
 
 		 752 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  19.35 
 
 		 795 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  19.31 
 
 		 792 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  18.55 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4578  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.91 
 
 		 335 aa  43.9  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>