76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2831 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 
629 aa  1259    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  55.61 
 
 
633 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  50 
 
 
654 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  51.9 
 
 
643 aa  548  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  39.61 
 
 
647 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  39.63 
 
 
643 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  41.5 
 
 
652 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  37.5 
 
 
638 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  38.46 
 
 
643 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  36 
 
 
620 aa  365  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  35.9 
 
 
620 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  37.09 
 
 
634 aa  353  4e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  34.64 
 
 
617 aa  345  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  33.86 
 
 
628 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  34.17 
 
 
652 aa  323  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  33.68 
 
 
656 aa  320  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  34.93 
 
 
636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  32.82 
 
 
640 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  33.79 
 
 
640 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  34.4 
 
 
640 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  31.75 
 
 
648 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  32.41 
 
 
648 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  33.13 
 
 
655 aa  294  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  34.39 
 
 
640 aa  293  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  32.98 
 
 
659 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  30 
 
 
800 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  32.62 
 
 
656 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  32.29 
 
 
667 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
659 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  29.29 
 
 
684 aa  280  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  32.39 
 
 
656 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  31.62 
 
 
651 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  31.62 
 
 
651 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  31.95 
 
 
651 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  30.46 
 
 
666 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  28.86 
 
 
665 aa  276  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  29.5 
 
 
646 aa  276  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  31.51 
 
 
651 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  31.62 
 
 
651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  30.63 
 
 
647 aa  270  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  30.66 
 
 
680 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  32.26 
 
 
634 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  27.86 
 
 
672 aa  260  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  30.95 
 
 
648 aa  257  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  29.17 
 
 
629 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  28.31 
 
 
673 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  29.97 
 
 
742 aa  216  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  35.12 
 
 
679 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  25.04 
 
 
686 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  34.49 
 
 
397 aa  182  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  27.53 
 
 
602 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  25.44 
 
 
838 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  24.84 
 
 
667 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  24.04 
 
 
607 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  23.44 
 
 
844 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  20.1 
 
 
795 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  20.04 
 
 
795 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  20.1 
 
 
795 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  29.41 
 
 
669 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  21.66 
 
 
1025 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  29.44 
 
 
663 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  24.05 
 
 
684 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  25.5 
 
 
675 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  25.98 
 
 
881 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  24.62 
 
 
678 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  26.94 
 
 
711 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  21.97 
 
 
955 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  19.14 
 
 
765 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  25.06 
 
 
744 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  23.55 
 
 
963 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  25.65 
 
 
771 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  21.98 
 
 
677 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  20.53 
 
 
760 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  25.31 
 
 
596 aa  48.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  25.93 
 
 
632 aa  47.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  22.54 
 
 
783 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>