76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1535 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  100 
 
 
742 aa  1530    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  42.54 
 
 
656 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  42.62 
 
 
651 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  42.49 
 
 
651 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  42.62 
 
 
651 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  42.49 
 
 
651 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  42.49 
 
 
651 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  41.86 
 
 
667 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  42.13 
 
 
656 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  41.86 
 
 
659 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  42.84 
 
 
640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  41.93 
 
 
659 aa  560  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  39.48 
 
 
652 aa  535  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  38.77 
 
 
646 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  42.75 
 
 
640 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  42.9 
 
 
640 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  40.81 
 
 
648 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  34.69 
 
 
647 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  34.69 
 
 
648 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  34.47 
 
 
617 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  35.08 
 
 
640 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  33.6 
 
 
656 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  34.06 
 
 
679 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  34.71 
 
 
636 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  35.64 
 
 
638 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  35.88 
 
 
620 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  34.36 
 
 
666 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  35.88 
 
 
620 aa  360  7e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  32.32 
 
 
648 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  39.44 
 
 
634 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  32.58 
 
 
800 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  33.69 
 
 
628 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  30.94 
 
 
634 aa  336  9e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  33.73 
 
 
655 aa  333  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  35.68 
 
 
647 aa  333  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  42.65 
 
 
397 aa  331  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  36.99 
 
 
629 aa  327  7e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  29.03 
 
 
684 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  28.65 
 
 
680 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  33.9 
 
 
652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  29.92 
 
 
665 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  30.39 
 
 
673 aa  283  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  27.67 
 
 
672 aa  280  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  30.11 
 
 
654 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  32.51 
 
 
643 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  33.97 
 
 
643 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  30.12 
 
 
629 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  30.1 
 
 
643 aa  230  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  30.51 
 
 
686 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  29.38 
 
 
633 aa  224  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  22.06 
 
 
1025 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.66 
 
 
803 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  25.94 
 
 
844 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.25 
 
 
795 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  25.57 
 
 
783 aa  76.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  21.64 
 
 
795 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  22 
 
 
795 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  22.16 
 
 
602 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.97 
 
 
641 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  21.65 
 
 
760 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  24.38 
 
 
711 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  23.89 
 
 
607 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  20.78 
 
 
955 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  19.37 
 
 
765 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  22.64 
 
 
771 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  20.04 
 
 
792 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  24.42 
 
 
614 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  24.37 
 
 
632 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  21.46 
 
 
838 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  21.28 
 
 
669 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  21.6 
 
 
663 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  22.3 
 
 
596 aa  50.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  23.05 
 
 
667 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  24.6 
 
 
744 aa  49.3  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  21.89 
 
 
678 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  25.3 
 
 
597 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>