55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  100 
 
 
643 aa  1302    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  68.61 
 
 
643 aa  868    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  40.13 
 
 
652 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  39.72 
 
 
647 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  39.72 
 
 
643 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  38.37 
 
 
638 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  35.91 
 
 
620 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  35.55 
 
 
620 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  36.91 
 
 
628 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  38.14 
 
 
654 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  36.06 
 
 
617 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  37.89 
 
 
633 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  38.46 
 
 
629 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  34.69 
 
 
634 aa  342  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  34.29 
 
 
640 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  35.04 
 
 
659 aa  321  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  32.83 
 
 
636 aa  318  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  31.39 
 
 
800 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  31.37 
 
 
656 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  30.66 
 
 
655 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  31 
 
 
651 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  31.2 
 
 
656 aa  296  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  30.85 
 
 
651 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  30.55 
 
 
651 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  30.7 
 
 
651 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  29.4 
 
 
652 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  31.16 
 
 
656 aa  291  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  31.27 
 
 
667 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  31.74 
 
 
640 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 
659 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  30.55 
 
 
651 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  30.99 
 
 
648 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  27.69 
 
 
646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  33.11 
 
 
640 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  29.38 
 
 
666 aa  280  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  33.73 
 
 
640 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  32.66 
 
 
648 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  31.91 
 
 
634 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  27.48 
 
 
672 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  28.77 
 
 
665 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  28.4 
 
 
673 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  27.77 
 
 
684 aa  250  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  29.62 
 
 
647 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  29.81 
 
 
648 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  28.28 
 
 
680 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  29.39 
 
 
742 aa  220  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  26.58 
 
 
629 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  33.61 
 
 
397 aa  190  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  27.62 
 
 
686 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  31.82 
 
 
679 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  24.52 
 
 
844 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  30 
 
 
632 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  24.05 
 
 
614 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  23.33 
 
 
846 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  22.13 
 
 
838 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>