84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2967 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 838 aa  1749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  40.61 
 
 		 667 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  39.74 
 
 		 678 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  41.34 
 
 		 677 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  37.1 
 
 		 675 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  35.11 
 
 		 684 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  35.43 
 
 		 669 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  35.56 
 
 		 663 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.83 
 
 		 963 aa  336  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  30.91 
 
 		 665 aa  99.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  23.98 
 
 		 632 aa  98.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  27.24 
 
 		 651 aa  98.6  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  26.93 
 
 		 651 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  26.93 
 
 		 651 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  26.63 
 
 		 651 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  26.63 
 
 		 651 aa  95.1  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  26.56 
 
 		 667 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 659 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  29.74 
 
 		 652 aa  92.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  26.56 
 
 		 656 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  26.25 
 
 		 656 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  24.9 
 
 		 640 aa  90.5  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  28.57 
 
 		 647 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  29.68 
 
 		 684 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  29.71 
 
 		 652 aa  83.2  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  30.63 
 
 		 672 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  27.71 
 
 		 648 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  29.17 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  25.16 
 
 		 638 aa  80.9  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  27.46 
 
 		 680 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  29.54 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  24.35 
 
 		 647 aa  78.2  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  25.82 
 
 		 654 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  23.36 
 
 		 659 aa  75.1  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  25.44 
 
 		 629 aa  74.3  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  22.27 
 
 		 628 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  25.47 
 
 		 602 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  23.68 
 
 		 634 aa  71.2  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  30.77 
 
 		 673 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  23.61 
 
 		 666 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  23.94 
 
 		 640 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  24.23 
 
 		 655 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  27.75 
 
 		 771 aa  67.8  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  25.53 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  26.12 
 
 		 633 aa  65.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  23.69 
 
 		 648 aa  64.3  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  37.98 
 
 		 596 aa  64.3  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  27.04 
 
 		 783 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  25.4 
 
 		 640 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  23.26 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  22.22 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  24.38 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  28.78 
 
 		 772 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  23.83 
 
 		 620 aa  60.1  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  25.96 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  23.28 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  21.94 
 
 		 1025 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1217 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  35 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  34.45 
 
 		 795 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  24.77 
 
 		 620 aa  57.4  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  24.91 
 
 		 679 aa  56.6  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  25.67 
 
 		 636 aa  57  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  31.03 
 
 		 846 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  21.37 
 
 		 686 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  33.61 
 
 		 795 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  33.61 
 
 		 795 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  30.82 
 
 		 1220 aa  55.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  22.04 
 
 		 617 aa  55.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  20.75 
 
 		 955 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  29.75 
 
 		 765 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  29.51 
 
 		 641 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  26.61 
 
 		 711 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7047  glycosyl hydrolase family 32 protein  27.27 
 
 		 818 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  32.23 
 
 		 803 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  20.56 
 
 		 646 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2598  hypothetical protein  28.04 
 
 		 225 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.243823  hitchhiker  0.00133027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  23.14 
 
 		 844 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0891  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 582 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.977532  normal  0.103657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  21.74 
 
 		 760 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  23.03 
 
 		 460 aa  44.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  22.13 
 
 		 643 aa  44.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  23.03 
 
 		 653 aa  44.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  20.7 
 
 		 742 aa  44.3  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>