84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03438 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1380    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  52.16 
 
 		 640 aa  686    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1382    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  47.2 
 
 		 652 aa  642    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  98.63 
 
 		 656 aa  1353    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  86 
 
 		 651 aa  1202    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  86 
 
 		 651 aa  1204    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  85.85 
 
 		 651 aa  1201    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  85.85 
 
 		 651 aa  1201    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  85.85 
 
 		 651 aa  1203    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  97.87 
 
 		 656 aa  1346    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  48.07 
 
 		 659 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  43.91 
 
 		 646 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  41.45 
 
 		 742 aa  570  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  41.73 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  41.34 
 
 		 648 aa  505  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  40.43 
 
 		 640 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  37.92 
 
 		 648 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  41 
 
 		 636 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  39.16 
 
 		 647 aa  482  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  39.14 
 
 		 640 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  38.89 
 
 		 656 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  40.52 
 
 		 638 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  37.36 
 
 		 617 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  37.52 
 
 		 620 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  37.21 
 
 		 620 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  40.23 
 
 		 647 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  36.71 
 
 		 655 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  37.8 
 
 		 628 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  34.91 
 
 		 648 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  35.58 
 
 		 634 aa  391  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  34.44 
 
 		 666 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  32.5 
 
 		 800 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  45.92 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  34.23 
 
 		 629 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  35.03 
 
 		 634 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  30.41 
 
 		 680 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  30.88 
 
 		 665 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  30.54 
 
 		 684 aa  339  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  35.28 
 
 		 652 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  30.26 
 
 		 672 aa  337  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  28.93 
 
 		 673 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  33.5 
 
 		 643 aa  320  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  31.6 
 
 		 686 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  31.78 
 
 		 643 aa  293  7e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  31.27 
 
 		 643 aa  290  7e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  34.61 
 
 		 654 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  35.66 
 
 		 679 aa  282  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  31.61 
 
 		 633 aa  281  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  32.29 
 
 		 629 aa  280  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  25.49 
 
 		 711 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  26.92 
 
 		 607 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  29.1 
 
 		 602 aa  104  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  25.5 
 
 		 684 aa  97.4  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  22.74 
 
 		 641 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  24.75 
 
 		 783 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  28.16 
 
 		 955 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  26.56 
 
 		 838 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  24.23 
 
 		 844 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  25.31 
 
 		 963 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  21.9 
 
 		 667 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.21 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  26.95 
 
 		 675 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  23.12 
 
 		 669 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  21.03 
 
 		 760 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  24.15 
 
 		 677 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  22.22 
 
 		 795 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  22.44 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  22.17 
 
 		 795 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  23.14 
 
 		 678 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  19.51 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  23.85 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  22.57 
 
 		 795 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  20.42 
 
 		 1025 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  23.27 
 
 		 771 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  22.59 
 
 		 632 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  22.78 
 
 		 792 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  22.48 
 
 		 596 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  24.19 
 
 		 752 aa  61.6  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  25.32 
 
 		 749 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  24 
 
 		 846 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  23.4 
 
 		 744 aa  50.8  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  25.52 
 
 		 881 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  19.02 
 
 		 597 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>